RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 FECHP22830 423 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 HTR2BP41595 481 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 EFNA3P52797 238 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 NRLP54845 237 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 F2RL1P55085 397 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 GRM2Q14416 872 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PTPRCAPQ14761 206 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ACTBL2Q562R1 376 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.34□□□□□ -1.39
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USP46-201ENST00000441222 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.34□□□□□ -1.39
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USP46-201ENST00000441222 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.34□□□□□ -1.39
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USP46-201ENST00000441222 ID2Q02363 134 aa6.34□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SPOCK1Q08629 439 aa6.34□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 NICN1Q9BSH3 213 aa6.34□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 DPH7Q9BTV6 452 aa6.34□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 NOXA1Q86UR1 476 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 SULF2Q8IWU5 870 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.33□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FNDC8Q8TC99 324 aa6.33□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 NT5C3BQ969T7 300 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 COG8Q96MW5 612 aa6.33□□□□□ -1.4
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USP46-201ENST00000441222 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.33□□□□□ -1.4
USP46-201ENST00000441222 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.33□□□□□ -1.4
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