RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 HDHD5Q9BXW7 423 aa19.02■□□□□ 0.64
UBE2B-201ENST00000265339 KCNH6Q9H252 994 aa19.02■□□□□ 0.64
UBE2B-201ENST00000265339 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa19.02■□□□□ 0.64
UBE2B-201ENST00000265339 AP3M1Q9Y2T2 418 aa19.02■□□□□ 0.64
UBE2B-201ENST00000265339 HSPB11Q9Y547 144 aa19.02■□□□□ 0.64
UBE2B-201ENST00000265339 EFCAB10A6NFE3 127 aa19.02■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CTSBP07858 339 aa19.02■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ADORA3P0DMS8 318 aa19.02■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TCTE3Q8IZS6 198 aa19.02■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJC22Q8N4W6 341 aa19.02■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP19.02■□□□□ 0.633e-10■■■□□ 16.1
UBE2B-201ENST00000265339 ASB15Q8WXK1 588 aa19.02■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 RXFP3Q9NSD7 469 aa19.02■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SOHLH2Q9NX45 425 aa19.02■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 GLTPQ9NZD2 209 aa19.02■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 V9GYH0 126 aa19.02■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PQM1 296 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 B4DXG7 233 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CDK1P06493 297 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 STSP08842 583 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 GRK6P43250 576 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SSR2P43308 183 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 MAGEA2P43356 314 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 RAB8AP61006 207 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SCN1BQ07699 218 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 NPRL3Q12980 569 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 LRIF1Q5T3J3 769 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 VWA5B2Q8N398 1253 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CAMKVQ8NCB2 501 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 IFI44Q8TCB0 444 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 C16orf78Q8WTQ4 265 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 GGHQ92820 318 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 KCNC2Q96PR1 638 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PRDM7Q9NQW5 492 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TSC22D2O75157 780 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 IL1RNP18510 177 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PRPS1L1P21108 318 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CCL7P80098 99 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SPEM2Q0P670 501 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF79Q15937 498 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM40Q6P9F5 258 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CSNK1A1LQ8N752 337 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 GAL3ST3Q96A11 431 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 GPR83Q9NYM4 423 aa19.01■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0A6YYD5 115 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM77I1YAP6 450 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TMPRSS11DO60235 418 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PDGFAP04085 211 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PTPN6P29350 595 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ASMTP46597 345 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 GABRA4P48169 554 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 LIMK1P53667 647 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CSNK2BP67870 215 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CREB3L2Q70SY1 520 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 VTCN1Q7Z7D3 282 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 OR8K5Q8NH50 307 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TESCQ96BS2 214 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 RNF121Q9H920 327 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 MYNNQ9NPC7 610 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ADAM29Q9UKF5 820 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SMLR1H3BR10 107 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ALPPP05187 535 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PCSK2P16519 638 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 C21orf58P58505 322 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R50P59544 299 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TNK1Q13470 666 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SQSTM1Q13501 440 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 UGT8Q16880 541 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 LIX1LQ8IVB5 337 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 LAX1Q8IWV1 398 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CARFQ8N187 725 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 STX19Q8N4C7 294 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 OR4M2Q8NGB6 313 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 QRFPRQ96P65 431 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PRRX2Q99811 253 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PDE7BQ9NP56 450 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 STARD5Q9NSY2 213 aa19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms