RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 CSO75390 466 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CYP7B1O75881 506 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 NKX2-2O95096 273 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OR5F1O95221 314 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CHRM4P08173 479 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 C8orf89P0DMQ9 161 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ST6GAL1P15907 406 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 WT1P19544 449 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ACVR2AP27037 513 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ELK4P28324 431 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ETV5P41161 510 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 MC3RP41968 323 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CASP9P55211 416 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CCL7P80098 99 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 MGAT2Q10469 447 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RTP5Q14D33 572 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 TRAM2Q15035 370 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 NPTX1Q15818 432 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 DECR1Q16698 335 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 MEDAGQ5VYS4 303 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 LAIR2Q6ISS4 152 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 GALNT10Q86SR1 603 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 TRIM73Q86UV7 250 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OR7G2Q8NG99 324 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OR7G1Q8NGA0 311 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OR9A2Q8NGT5 310 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RACGAP1Q9H0H5 632 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 DKK4Q9UBT3 224 aa9.93□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 IRGMA1A4Y4 181 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 EFCAB10A6NFE3 127 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC160A6NGH7 325 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 AGAP5A6NIR3 686 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SNTNA6NMZ2 147 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 B4DGG1 531 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 AP3D1O14617 1153 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF749O43361 778 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 B4GAT1O43505 415 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RGS10O43665 173 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 NOL3O60936 208 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 UGT2B17O75795 530 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 C1QL1O75973 258 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PIPP12273 146 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 TYRP1P17643 537 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 GABRB1P18505 474 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CDH15P55291 814 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 HSD11B2P80365 405 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 DAB2P98082 770 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CHRNEQ04844 493 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 DUSP2Q05923 314 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PMS2P3Q13401 168 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RAB39AQ14964 217 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 NCF4Q15080 339 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OCLNQ16625 522 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ISXQ2M1V0 245 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 XAF1Q6GPH4 301 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RRM2BQ7LG56 351 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CMIPQ8IY22 773 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SLC43A2Q8N370 569 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF540Q8NDQ6 660 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OR5D16Q8NGK9 328 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OR8J1Q8NGP2 316 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 COL26A1Q96A83 441 aa9.92□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms