RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-208ENST00000484101 CHST10O43529 356 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 DYRK3O43781 588 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 PCDHGA12O60330 932 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 PRAMEF2O60811 474 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 RDH16O75452 317 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 NKX2-2O95096 273 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 HTR1AP08908 422 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SP9P0CG40 484 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 ALPPL2P10696 532 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 NID1P14543 1247 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 GLB1P16278 677 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 CCNA2P20248 432 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 AGXTP21549 392 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 TGM1P22735 817 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 CHMP24386 653 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SLC5A2P31639 672 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 MAP3K8P41279 467 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 CTSKP43235 329 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 PSPHP78330 225 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 NPTX1Q15818 432 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 DECR1Q16698 335 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 DCST2Q5T1A1 773 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 MEDAGQ5VYS4 303 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 C1orf94Q6P1W5 598 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 CASP12Q6UXS9 341 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 PRSS42Q7Z5A4 293 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 CMIPQ8IY22 773 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SLC43A2Q8N370 569 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SLC9A6Q92581 669 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 CDS1Q92903 461 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SLC35A4Q96G79 324 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 CRELD1Q96HD1 420 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 MAP3K3Q99759 626 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 COPS4Q9BT78 406 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 NCDNQ9UBB6 729 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 PRODH2Q9UF12 536 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 CDC14AQ9UNH5 594 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 PTGES3LE9PB15 166 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 H3BMQ9 156 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 K7ESF4 209 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SGK494L7N484 410 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 M0R3G1 203 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 STK25O00506 426 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 B4GAT1O43505 415 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 GASTP01350 101 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 ACP2P11117 423 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 PNLIPP16233 465 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 GABRB1P18505 474 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 FMO3P31513 532 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 GABRA4P48169 554 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 SMSP52788 366 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 PDX1P52945 283 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 PPP1CAP62136 330 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 CHRNEQ04844 493 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 STX4Q12846 297 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 DUSP5Q16690 384 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 GPR107Q5VW38 600 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 C12orf73Q69YU5 71 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 RRM2BQ7LG56 351 aa8.98□□□□□ -0.97
UFD1-208ENST00000484101 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms