RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 ABCB11O95342 1321 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 OGTO15294 1046 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 VPS26AO75436 327 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 CLN5O75503 358 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 SYNGR4O95473 234 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 MT-ND2P03891 347 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 YES1P07947 543 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF224P0DH78 156 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 EPB41P11171 864 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 EZRP15311 586 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 DRD5P21918 477 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 IL4RP24394 825 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 PRDX2P32119 198 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 CETN2P41208 172 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 PDLIM4P50479 330 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 UCNP55089 124 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNK10P57789 538 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 SP4Q02446 784 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 HSF2Q03933 536 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 EXT1Q16394 746 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 ADPRMQ3LIE5 342 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 PPM1LQ5SGD2 360 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 C17orf107Q6ZR85 190 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 LPCAT2Q7L5N7 544 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC17Q8N6Y2 441 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4C15Q8NGM1 316 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4L1Q8NH43 312 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB39BQ96DA2 213 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 CXorf58Q96LI9 332 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 C4orf45Q96LM5 186 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 BTBD9Q96Q07 612 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHB18PQ96TA0 734 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 LGMNQ99538 433 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 RMND5AQ9H871 391 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 FANCFQ9NPI8 374 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 MARCH5Q9NX47 278 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 GTSE1Q9NYZ3 720 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 ASB3Q9Y575 518 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 ETV7Q9Y603 341 aa4.97□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 ARID2Q68CP9 1835 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 UBXN8O00124 270 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TOMM40O96008 361 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP1B1P05026 303 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 PRSS2P07478 247 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CALCBP10092 127 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 RALAP11233 206 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CDK4P11802 303 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 GLRA2P23416 452 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 HOXA9P31269 272 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 STIP1P31948 543 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE2HP62256 183 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SNX1Q13596 522 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 AGKQ53H12 422 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 VASH2Q86V25 355 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SFR1Q86XK3 245 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MISPQ8IVT2 679 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC43A2Q8N370 569 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 FADS6Q8N9I5 356 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF149Q8NC42 400 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 METTL21AQ8WXB1 218 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TCEAL4Q96EI5 215 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TTC25Q96NG3 672 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 NEDD4LQ96PU5 975 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SNX6Q9UNH7 406 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa4.96□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SERINC4A6NH21 518 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 K7ENP7 123 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SOCS2O14508 198 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CSO75390 466 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TXNDC12O95881 172 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHV4-39P01824 125 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CLUP10909 449 aa4.95□□□□□ -1.62
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