RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 FCMRO60667 390 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 NKX2-2O95096 273 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 ZNF806P0C7X5 589 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 PRKACGP22612 351 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 RRM2P31350 389 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 EMDP50402 254 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 VWA2Q5GFL6 755 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 ZG16BQ96DA0 208 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 PIP5K1AQ99755 562 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 PINK1Q9BXM7 581 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 SMURF2Q9HAU4 748 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 FTSJ1Q9UET6 329 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 VPS13AQ96RL7 3174 aa15.24■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 TRIM64BA6NI03 449 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 HRKO00198 91 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 SCRG1O75711 98 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 LGI1O95970 557 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 AK1P00568 194 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 ALPPP05187 535 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 TNNI3P19429 210 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 SSTR4P31391 388 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 RHAGQ02094 409 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 MFSD4BQ5TF39 518 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 DHRSXQ8N5I4 330 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 COX18Q8N8Q8 333 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 SLC38A9Q8NBW4 561 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 GPR151Q8TDV0 419 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 SLC22A11Q9NSA0 550 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 OCIAD1Q9NX40 245 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 WDR45Q9Y484 360 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 TESMINQ9Y4I5 508 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa15.23■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 J3KTA2 159 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 AGRPO00253 132 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 PRAMEF2O60811 474 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 TIAF1O95411 115 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 SNAP29O95721 258 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 HBQ1P09105 142 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 THRBP10828 461 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 GABRA3P34903 492 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 CAPGP40121 348 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 EPS8Q12929 822 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 IL11RAQ14626 422 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 ZNF311Q5JNZ3 666 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 DCST2Q5T1A1 773 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 COX15Q7KZN9 410 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 ZNF605Q86T29 641 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 PIK3R3Q92569 461 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 CNPPD1Q9BV87 410 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 ZNF350Q9GZX5 532 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 FOLH1BQ9HBA9 442 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 MKLN1Q9UL63 735 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 ERVK-19Q9WJR5 959 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 DMDP11532 3685 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 C17orf105B2RV13 164 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 TNFRSF11BO00300 401 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 SYT5O00445 386 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 STX11O75558 287 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 EPPINO95925 133 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 FGF5P12034 268 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 CD59P13987 128 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 RORAP35398 523 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 PGDP52209 483 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 HMGA2P52926 109 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 PSG6Q00889 435 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 SPIBQ01892 262 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 TCTN3Q6NUS6 607 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 USP51Q70EK9 711 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 COMTD1Q86VU5 262 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 AGBL5Q8NDL9 886 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 OR4D11Q8NGI4 311 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 OR52P1PQ8NH57 321 aa15.22■□□□□ 0.03
USP20-204ENST00000472108 PMM1Q92871 262 aa15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms