RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 HMOX2P30519 316 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 ALDH3A1P30838 453 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 XKP51811 444 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 DIO3P55073 304 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 PLCXD2Q0VAA5 305 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 SNTA1Q13424 505 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 NNATQ16517 81 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 SGO1Q5FBB7 561 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 SLC30A6Q6NXT4 461 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 SLC48A1Q6P1K1 146 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 Q71RC1 249 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 LUZP2Q86TE4 346 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 CCNYL1Q8N7R7 359 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 TCP10LQ8TDR4 215 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 UCN3Q969E3 161 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 PGM2Q96G03 612 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 ZIM3Q96PE6 472 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 FAM111AQ96PZ2 611 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 SMR3AQ99954 134 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 TUBA1CQ9BQE3 449 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 MID1IP1Q9NPA3 183 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 TIMM22Q9Y584 194 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 ACTL7BQ9Y614 415 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 C1orf226A1L170 272 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 SNPHO15079 494 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 ACOX3O15254 700 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 NPHS1O60500 1241 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 GUCY1B2O75343 617 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 DHRS4L1P0CG22 281 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 UROSP10746 265 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 PORP16435 677 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 DEKP35659 375 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 SOX18P35713 384 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 GSTM5P46439 218 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 MAPK12P53778 367 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 SRYQ05066 204 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 FOXF2Q12947 444 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 GAB1Q13480 694 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 UGT3A2Q3SY77 523 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 KRT71Q3SY84 523 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 SPIN4Q56A73 249 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 TMEM81Q6P7N7 255 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 NUP54Q7Z3B4 507 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 EXOC3L1Q86VI1 746 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 IFNEQ86WN2 208 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 HOMEZQ8IX15 550 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 WNT2BQ93097 391 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 OMA1Q96E52 524 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 APIPQ96GX9 242 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 FCRL1Q96LA6 429 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 BRINP2Q9C0B6 783 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 GALNT9Q9HCQ5 603 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 SERHLQ9NQF3 203 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 BCAP29Q9UHQ4 241 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 PACSIN3Q9UKS6 424 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 MAPRE3Q9UPY8 281 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 VPS13CQ709C8 3753 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 PRAMEF25A6NGN4 478 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 ICOSLGO75144 302 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 SPAG7O75391 227 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 CBR3O75828 277 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 RCBTB2O95199 551 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 ATP1B1P05026 303 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 HEXAP06865 529 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 BPGMP07738 259 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 CHMP24386 653 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.616e-12■■■■■ 39.4
PRAME-204ENST00000403441 ARRB2P32121 409 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 CPOXP36551 454 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 SERPINB5P36952 375 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 HMGCS1Q01581 520 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 KIAA0040Q15053 153 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 Q5PR19 223 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 KANK2Q63ZY3 851 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 AAGABQ6PD74 315 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 CROCCP2Q86T23 111 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 P3H2Q8IVL5 708 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 GCNT2Q8N0V5 402 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 CCDC63Q8NA47 563 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 FAM76AQ8TAV0 307 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 HGDQ93099 445 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-204ENST00000403441 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms