RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR10H1Q9Y4A9 318 aa16.05■□□□□ 0.16
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CCNDBP1-204ENST00000563065 ACOX3O15254 700 aa16.04■□□□□ 0.16
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CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 C6orf120Q7Z4R8 191 aa16.03■□□□□ 0.16
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CCNDBP1-204ENST00000563065 OR2M7Q8NG81 312 aa16.03■□□□□ 0.16
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CCNDBP1-204ENST00000563065 JADE3Q92613 823 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC35A4Q96G79 324 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 SIKE1Q9BRV8 207 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 SERHL2Q9H4I8 314 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF385DQ9H6B1 395 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC6A13Q9NSD5 602 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 FLRT3Q9NZU0 649 aa16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-204ENST00000563065 TP53I11O14683 189 aa16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-204ENST00000563065 NKX2-2O95096 273 aa16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-204ENST00000563065 NAGAP17050 411 aa16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-204ENST00000563065 FOXK1P85037 733 aa16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1-204ENST00000563065 INAQ16352 499 aa16.02■□□□□ 0.15
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