RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559253.1

IPO4-208, Transcript of importin 4, humanhuman

TSL 4

Gene IPO4, Length 579 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO4-208ENST00000559253 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 GXYLT1Q4G148 440 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 PRR22Q8IZ63 422 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 TMBIM1Q969X1 311 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ASIC5Q9NY37 505 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.95□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ICOSLGO75144 302 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 CLDN14O95500 239 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 CELA3AP09093 270 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 GABRA1P14867 456 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ACVR2AP27037 513 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 HPCAL1P37235 193 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 DCTP40126 519 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 CORO7P57737 925 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 C21orf58P58505 322 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 PSG6Q00889 435 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 CHI3L2Q15782 390 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 NNATQ16517 81 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 GALNTL6Q49A17 601 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 NHSL2Q5HYW2 709 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 WLSQ5T9L3 541 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 TMEM107Q6UX40 140 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ASB5Q8WWX0 329 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 TSSK3Q96PN8 268 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 CENPHQ9H3R5 247 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 RUBCNLQ9H714 662 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 HHATLQ9HCP6 504 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 Q9N2J8 555 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 LIPGQ9Y5X9 500 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.94□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 SNPHO15079 494 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 REM1O75628 298 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 SOX30O94993 753 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 PRPS1L1P21108 318 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 GDF1P27539 372 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 PTPN6P29350 595 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 IL12BP29460 328 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 PTGDSP41222 190 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 MPP2Q14168 576 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 21.7
IPO4-208ENST00000559253 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 BICRALQ6AI39 1079 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 LIX1Q8N485 282 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 NODALQ96S42 347 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 KLRF1Q9NZS2 232 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.93□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ZNF407Q9C0G0 2248 aa14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 PRSS44E7EML9 344 aa14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 PEX11AO75192 247 aa14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 CBR3O75828 277 aa14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 HTR1EP28566 365 aa14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 CHRNB4P30926 498 aa14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 MAP3K8P41279 467 aa14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 EMX2Q04743 252 aa14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 DECR1Q16698 335 aa14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.92□□□□□ -0.02
IPO4-208ENST00000559253 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms