RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 CEP85LQ5SZL2 805 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 SLC22A9Q8IVM8 553 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 BANPQ8N9N5 519 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 WDSUB1Q8N9V3 476 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 CTHRC1Q96CG8 243 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 UCN2Q96RP3 112 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 SFXN3Q9BWM7 321 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 BRINP2Q9C0B6 783 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 GALNT9Q9HCQ5 603 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 SENP1Q9P0U3 644 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 GOLGA6L10A6NI86 522 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ACOX3O15254 700 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ERN1O75460 977 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 CBR3O75828 277 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 RCBTB2O95199 551 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 CBX7O95931 251 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 HOXC12P31275 282 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 GCKP35557 465 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 MAPK12P53778 367 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 PRKAA2P54646 552 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 DUSP2Q05923 314 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 PLCXD2Q0VAA5 305 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 IFT88Q13099 833 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ZYG11AQ6WRX3 759 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 COMMD6Q7Z4G1 85 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 BIVMQ86UB2 503 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 SIMC1Q8NDZ2 872 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 RDH11Q8TC12 318 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 CCDC126Q96EE4 140 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 DACH2Q96NX9 599 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 YIPF4Q9BSR8 244 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 KLRF1Q9NZS2 232 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 BCAP29Q9UHQ4 241 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 MAPRE3Q9UPY8 281 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 PLLPQ9Y342 182 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-212ENST00000492539 A0A1W2PPR1 153 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 C2orf72A6NCS6 295 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 G3V2L1 256 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TO15178 435 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 UGT2B11O75310 529 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 GUCY1B2O75343 617 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 MYL2P10916 166 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 DRD2P14416 443 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CD53P19397 219 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 FEN1P39748 380 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 GFRA1P56159 465 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 DCAF7P61962 342 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ZNF678Q5SXM1 525 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TM4SF18Q96CE8 201 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TMEM237Q96Q45 408 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TM9SF2Q99805 663 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 G6PC3Q9BUM1 346 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SERHLQ9NQF3 203 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 GALNT8Q9NY28 637 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CLCF1Q9UBD9 225 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 PRAMEF25A6NGN4 478 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 H0Y3Z8 333 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 IMPDH1P20839 514 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 DRD5P21918 477 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 PPICP45877 212 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ENPP6Q6UWR7 440 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 LUZP2Q86TE4 346 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TRIM42Q8IWZ5 723 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 OR4F6Q8NGB9 312 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 OR52R1Q8NGF1 315 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 OR14L1PQ8NHC6 308 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SMPDL3BQ92485 455 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 WNT2BQ93097 391 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 L3HYPDHQ96EM0 354 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 PGM2Q96G03 612 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ZNF681Q96N22 645 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ELOVL6Q9H5J4 265 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 EHD3Q9NZN3 535 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 MID2Q9UJV3 735 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SLC12A4Q9UP95 1085 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 A0A1B0GTL3 188 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SH3D21A4FU49 640 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 FRG2CA6NGY1 282 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 EMDP50402 254 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 LHX2P50458 406 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 POU4F3Q15319 338 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms