RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 OPN1MW3P0DN78 364 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 MARK3P27448 753 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 SSTP61278 116 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBTB17Q13105 803 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 KIR2DS3Q14952 304 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 USH1GQ495M9 461 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 NADK2Q4G0N4 442 aa4.99□□□□□ -1.61
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STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGEF16Q5VV41 709 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 NKAIN2Q5VXU1 208 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 UGT3A1Q6NUS8 523 aa4.99□□□□□ -1.61
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STRADBP1-201ENST00000478954 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 BCORP1Q8N888 145 aa4.99□□□□□ -1.61
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STRADBP1-201ENST00000478954 SLC47A1Q96FL8 570 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 CNDP1Q96KN2 507 aa4.99□□□□□ -1.61
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STRADBP1-201ENST00000478954 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.99□□□□□ -1.61
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STRADBP1-201ENST00000478954 PILRAQ9UKJ1 303 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 PLIN4Q96Q06 1357 aa4.99□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 WDR19Q8NEZ3 1342 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 COL6A5A8TX70 2615 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1W2PN81 502 aa4.98□□□□□ -1.61
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STRADBP1-201ENST00000478954 SYNGR3O43761 229 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 GMFGO60234 142 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 PALMO75781 387 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 PIGNO95427 931 aa4.98□□□□□ -1.61
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STRADBP1-201ENST00000478954 SERPINF2P08697 491 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
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STRADBP1-201ENST00000478954 OR3A3P47888 321 aa4.98□□□□□ -1.61
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STRADBP1-201ENST00000478954 SQLEQ14534 574 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
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STRADBP1-201ENST00000478954 KIF26BQ2KJY2 2108 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC00303Q3SY05 128 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC25A53Q5H9E4 307 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 CENPPQ6IPU0 288 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF425Q6IV72 752 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 C11orf87Q6NUJ2 197 aa4.98□□□□□ -1.61
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STRADBP1-201ENST00000478954 B3GALT6Q96L58 329 aa4.98□□□□□ -1.61
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STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
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STRADBP1-201ENST00000478954 DPEP2Q9H4A9 486 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 GORASP2Q9H8Y8 452 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 VAT1LQ9HCJ6 419 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 CHST11Q9NPF2 352 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 HOMER3Q9NSC5 361 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 ATAD3AQ9NVI7 634 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.98□□□□□ -1.61
STRADBP1-201ENST00000478954 ERVK-19Q9WJR5 959 aa4.98□□□□□ -1.61
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