RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 V9GYQ6 96 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PRAG1Q86YV5 1406 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ABCC4O15439 1325 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 BCL9LQ86UU0 1499 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 AKAP12Q02952 1782 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CEP350Q5VT06 3117 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 DAPK1P53355 1430 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A075B6Q4 140 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A0U1RQV5 110 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A1W2PRG6 482 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 OR5K3A6NET4 321 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF716A6NP11 495 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 F8W036 122 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PDXKO00764 312 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ARPC2O15144 300 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 OGTO15294 1046 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 MED7O43513 233 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ITM2AO43736 263 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 LDB3O75112 727 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CDH16O75309 829 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ECI2O75521 394 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CBR3O75828 277 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CABYRO75952 493 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SYNGR4O95473 234 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 OTCP00480 354 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 IL1BP01584 269 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 MBP02144 154 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 FABP1P07148 127 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 FHP07954 510 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 HMBSP08397 361 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 GNAO1P09471 354 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF735P0CB33 412 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 UMPSP11172 480 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 DBTP11182 482 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 RALBP11234 206 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 MLNP12872 115 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ICAM2P13598 275 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 GP9P14770 177 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ITGB6P18564 788 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 S1PR1P21453 382 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 GNLYP22749 145 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SERPINB1P30740 379 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SFTPDP35247 375 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 RFC2P35250 354 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SERPINB5P36952 375 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 RPL3P39023 403 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CAPGP40121 348 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 MNDAP41218 407 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 MAGEA1P43355 309 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC1A6P48664 564 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CASP4P49662 377 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SERPINB9P50453 376 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TNFSF10P50591 281 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 RASSF2P50749 326 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 VAMP7P51809 220 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PDX1P52945 283 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 GPX6P59796 221 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 RPS8P62241 208 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 FKBP1BP68106 108 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SMCO1Q147U7 214 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 EFNB3Q15768 340 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CA9Q16790 459 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 DUSP6Q16828 381 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 UGT3A2Q3SY77 523 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF311Q5JNZ3 666 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TEX30Q5JUR7 227 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 OR4A47Q6IF82 309 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TTC27Q6P3X3 843 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 NIPAL3Q6P499 406 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 PLXDC2Q6UX71 529 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 DEF8Q6ZN54 512 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 USP43Q70EL4 1123 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 FRA10AC1Q70Z53 315 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 Q75L30 129 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 HORMAD1Q86X24 394 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 CHSY1Q86X52 802 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 SFR1Q86XK3 245 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-205ENST00000460278 TBC1D10CQ8IV04 446 aa3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms