RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000005841.15

Ctcf-201, Transcript of Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctcf, Length 3,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Cfl1P18760 166 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gbx2P48031 348 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr681Q3SXH8 315 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Snx33Q4VAA7 574 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Foxj1Q61660 421 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Defb14Q7TNV9 67 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Trim50Q810I2 483 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 NagsQ8R4H7 527 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr202Q8VGQ3 307 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr679Q8VGV0 315 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Kcnj10Q9JM63 379 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Cyp11a1Q9QZ82 526 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 PtgdsO09114 189 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 NnmtO55239 264 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Ankrd9Q8BH83 326 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr790Q8VGJ3 322 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Ctrb1Q9CR35 263 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Trim13Q9CYB0 407 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 SrpraQ9DBG7 636 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Thbs4Q9Z1T2 963 aa15.95■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Col4a2P08122 1707 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Socs5O54928 536 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 PtgirP43252 415 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Fads2p1Q0VAX3 487 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Dus4lQ32M08 324 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gpr162Q3UN16 588 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gpr19Q61121 415 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Spin1Q61142 262 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Eid2Q6X7S9 236 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gpr142Q7TQN9 365 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Znf32Q80V23 272 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Mmp28Q8CGV8 520 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Pdzd3Q99MJ6 498 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 ClpsQ9CQC2 113 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 5530400C23RikQ9D3I0 173 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Ift46Q9DB07 301 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr44Q9EQB8 314 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gm5152L7N200 190 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Rem1O35929 297 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Bcl6P41183 707 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 B4galnt2Q09199 510 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Itpripl2Q3UV16 535 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Atp11bQ6DFW5 1175 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Lkaaear1Q8BIG2 198 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Tmem17Q8K0U3 198 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gm6133B2RY53 190 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Vmn2r13L7N1X2 831 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Tgfb1P04202 390 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 March5Q3KNM2 278 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Cdkn2dQ60773 166 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Dtd2Q8BHA3 168 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Tusc3Q8BTV1 347 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Uxs1Q91XL3 420 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Tvp23bQ9D8T4 205 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Izumo2Q9DA16 220 aa15.94■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Hoxd8P23463 289 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Hnf4aP49698 474 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Kdm4dQ3U2K5 510 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Pkp4Q68FH0 1190 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr1051Q7TR76 308 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Plcz1Q8K4D7 647 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Tsen15Q8R3W5 168 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Ing3Q8VEK6 421 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Asah2Q9JHE3 756 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Fam43bA2AM80 330 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 F2rl3O88634 396 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Slc6a1P31648 599 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Kcna7Q17ST2 489 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Stox2Q499E5 926 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Nfe2l2Q60795 597 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Ugt2b37Q8VCN3 530 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 ClcnkaQ9WUB7 687 aa15.93■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr1224-ps1A3KGY4 311 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Trabd2bB1ATG9 517 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Irf7P70434 457 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Foxs1Q61574 329 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Cxxc1Q9CWW7 660 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Dimt1Q9D0D4 313 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Calhm1D3Z291 348 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 CatsperdE9Q9F6 805 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Coro1aO89053 461 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 OcmP51879 109 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 PtpaP58389 323 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Shkbp1Q6P7W2 704 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Baiap2Q8BKX1 535 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Bbs4Q8C1Z7 520 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Zfp119bQ8K0G9 543 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr77Q8VEY9 312 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr98Q8VFD9 309 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 GgactQ923B0 149 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Amdhd1Q9DBA8 426 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Pkmyt1Q9ESG9 490 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Cyp2d22Q9JKY7 500 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Tbl2Q9R099 442 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gdf2Q9WV56 428 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Ttll3A4Q9E5 927 aa15.92■□□□□ 0.14
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Slco5a1E9PVD9 850 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.7 ms