Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,64■■■□□ 2,98
Tgfb1P04202 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,72
Tgfb1P04202 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Tgfb1P04202 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,53
Tgfb1P04202 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Tgfb1P04202 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Tgfb1P04202 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Tgfb1P04202 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
Tgfb1P04202 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Tgfb1P04202 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Tgfb1P04202 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Tgfb1P04202 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Tgfb1P04202 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Tgfb1P04202 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Tgfb1P04202 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Tgfb1P04202 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tgfb1P04202 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Tgfb1P04202 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Tgfb1P04202 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tgfb1P04202 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Tgfb1P04202 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Tgfb1P04202 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Tgfb1P04202 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Tgfb1P04202 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tgfb1P04202 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Tgfb1P04202 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
Tgfb1P04202 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Tgfb1P04202 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
Tgfb1P04202 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tgfb1P04202 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Tgfb1P04202 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
Tgfb1P04202 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Tgfb1P04202 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Tgfb1P04202 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Tgfb1P04202 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Tgfb1P04202 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Tgfb1P04202 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Tgfb1P04202 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Tgfb1P04202 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Tgfb1P04202 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Tgfb1P04202 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Tgfb1P04202 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Tgfb1P04202 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,97
Tgfb1P04202 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Tgfb1P04202 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Tgfb1P04202 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tgfb1P04202 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Tgfb1P04202 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Tgfb1P04202 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Tgfb1P04202 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tgfb1P04202 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Tgfb1P04202 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Tgfb1P04202 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Tgfb1P04202 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Tgfb1P04202 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Tgfb1P04202 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Tgfb1P04202 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Tgfb1P04202 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Tgfb1P04202 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Tgfb1P04202 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Tgfb1P04202 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Tgfb1P04202 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Tgfb1P04202 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Tgfb1P04202 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Tgfb1P04202 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Tgfb1P04202 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Tgfb1P04202 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Tgfb1P04202 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Tgfb1P04202 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Tgfb1P04202 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,41■■□□□ 1,82
Tgfb1P04202 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Tgfb1P04202 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Tgfb1P04202 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Tgfb1P04202 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Tgfb1P04202 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Tgfb1P04202 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Tgfb1P04202 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Tgfb1P04202 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tgfb1P04202 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Tgfb1P04202 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Tgfb1P04202 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Tgfb1P04202 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Tgfb1P04202 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tgfb1P04202 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Tgfb1P04202 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Tgfb1P04202 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Tgfb1P04202 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Tgfb1P04202 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Tgfb1P04202 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Tgfb1P04202 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Tgfb1P04202 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Tgfb1P04202 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Tgfb1P04202 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Tgfb1P04202 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Tgfb1P04202 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Tgfb1P04202 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Tgfb1P04202 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Tgfb1P04202 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Tgfb1P04202 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Tgfb1P04202 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,5 ms