Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Tgfb1P04202 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Tgfb1P04202 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tgfb1P04202 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Tgfb1P04202 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tgfb1P04202 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tgfb1P04202 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Tgfb1P04202 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Tgfb1P04202 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tgfb1P04202 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Tgfb1P04202 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tgfb1P04202 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Tgfb1P04202 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tgfb1P04202 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Tgfb1P04202 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tgfb1P04202 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tgfb1P04202 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tgfb1P04202 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tgfb1P04202 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tgfb1P04202 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tgfb1P04202 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tgfb1P04202 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tgfb1P04202 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tgfb1P04202 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tgfb1P04202 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tgfb1P04202 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tgfb1P04202 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tgfb1P04202 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Tgfb1P04202 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tgfb1P04202 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tgfb1P04202 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Tgfb1P04202 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tgfb1P04202 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tgfb1P04202 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tgfb1P04202 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tgfb1P04202 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tgfb1P04202 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tgfb1P04202 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tgfb1P04202 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tgfb1P04202 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tgfb1P04202 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tgfb1P04202 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Tgfb1P04202 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tgfb1P04202 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tgfb1P04202 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tgfb1P04202 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tgfb1P04202 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgfb1P04202 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgfb1P04202 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tgfb1P04202 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tgfb1P04202 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tgfb1P04202 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tgfb1P04202 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tgfb1P04202 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tgfb1P04202 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tgfb1P04202 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tgfb1P04202 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tgfb1P04202 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Tgfb1P04202 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tgfb1P04202 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tgfb1P04202 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tgfb1P04202 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tgfb1P04202 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tgfb1P04202 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tgfb1P04202 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tgfb1P04202 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tgfb1P04202 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tgfb1P04202 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tgfb1P04202 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tgfb1P04202 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tgfb1P04202 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tgfb1P04202 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Tgfb1P04202 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tgfb1P04202 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tgfb1P04202 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tgfb1P04202 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tgfb1P04202 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tgfb1P04202 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tgfb1P04202 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tgfb1P04202 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tgfb1P04202 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tgfb1P04202 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tgfb1P04202 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tgfb1P04202 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tgfb1P04202 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tgfb1P04202 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tgfb1P04202 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tgfb1P04202 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tgfb1P04202 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tgfb1P04202 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tgfb1P04202 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tgfb1P04202 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tgfb1P04202 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tgfb1P04202 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tgfb1P04202 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tgfb1P04202 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tgfb1P04202 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgfb1P04202 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tgfb1P04202 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tgfb1P04202 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms