RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CENPHQ9H3R5 247 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CHST11Q9NPF2 352 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 NOTCH2Q04721 2471 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 CACNA1DQ01668 2161 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 OR14I1A6ND48 311 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 BCKDKO14874 412 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 REM1O75628 298 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PPM1BO75688 479 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SNX4O95219 450 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 CLDN14O95500 239 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 CBX7O95931 251 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 CELA3AP09093 270 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00032P0C843 101 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 NEFHP12036 1026 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 DDCP20711 480 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 AGAP20933 346 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 GDF1P27539 372 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 NTSP30990 170 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PPICP45877 212 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 TRPC1P48995 793 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 GUCY1A3Q02108 690 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 MGAT2Q10469 447 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PMPCAQ10713 525 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 FOXO1Q12778 655 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SNCBQ16143 134 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 KRT71Q3SY84 523 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 GALNTL6Q49A17 601 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF628Q5EBL2 1059 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 TRILQ7L0X0 811 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 HOMEZQ8IX15 550 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 CLYBLQ8N0X4 340 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 RND1Q92730 232 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SARAFQ96BY9 339 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 OMA1Q96E52 524 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF597Q96LX8 424 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 RILPQ96NA2 401 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 TRMOQ9BU70 441 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 MECRQ9BV79 373 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRA2Q9H9E1 313 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 BATF3Q9NR55 127 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf109Q9NX04 203 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 MKS1Q9NXB0 559 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R9Q9NYW1 312 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 EHD3Q9NZN3 535 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 KLRF1Q9NZS2 232 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF639Q9UID6 485 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 NCKAP5O14513 1909 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 LRBAP50851 2863 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC13O75165 2243 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 WDR91A4D1P6 747 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 AQP7O14520 342 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 GNB5O14775 395 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ACOX3O15254 700 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SUSD5O60279 629 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 NPHS1O60500 1241 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 HCN1O60741 890 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 COQ9O75208 318 aa7.63□□□□□ -1.19
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