RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525997.1

PUM1-216, Transcript of pumilio RNA binding family member 1, human

TSL 3

Gene PUM1, Length 650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM1-216	ENST00000525997	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	NPAS2	Q99743	824 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	LHPP	Q9H008	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	SPTBN2	O15020	2390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997		A0A087WV48	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997		H3BNH8	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997		K7ENP7	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	FBP2	O00757	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	TP53I11	O14683	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	T	O15178	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	EFS	O43281	561 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	NKX2-2	O95096	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	PSMG1	O95456	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	CBX6	O95503	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	CBX7	O95931	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	ITGB2	P05107	769 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	GUSB	P08236	651 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	NR2F1	P10589	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	PRKAR1A	P10644	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	BMP2	P12643	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	HPGD	P15428	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	NAGA	P17050	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	GPX2	P18283	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	F8A1	P23610	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	SLC6A2	P23975	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	IL12B	P29460	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	SSTR4	P31391	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	PPIC	P45877	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	SSR4	P51571	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	GPR143	P51810	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	SLC7A2	P52569	658 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	CRISP3	P54108	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	SLC37A1	P57057	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	SOX8	P57073	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	DSTN	P60981	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	PSME3	P61289	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	RNF4	P78317	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	PHC1	P78364	1004 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	GUCA2A	Q02747	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	BNIP1	Q12981	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	BNIP2	Q12982	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	GAB1	Q13480	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	RGN	Q15493	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	FHL5	Q5TD97	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-216	ENST00000525997	RETREG3	Q86VR2	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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