RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 TAS2R38P59533 333 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 MAP4K2Q12851 820 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 CDK10Q15131 360 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.672e-6■□□□□ 8.1
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF628Q5EBL2 1059 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 QSOX2Q6ZRP7 698 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 C11orf74Q86VG3 221 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 GALNT12Q8IXK2 581 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 VWA5B2Q8N398 1253 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 LILRB4Q8NHJ6 448 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 DEPDC7Q96QD5 511 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 KLHL31Q9H511 634 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 IRGMA1A4Y4 181 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 PLA2G10O15496 165 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ADH1CP00326 375 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 STATHP02808 62 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 LIMS3P0CW19 117 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 LIMS4P0CW20 117 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 GABRA5P31644 462 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 DUSP6Q16828 381 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 GPAT3Q53EU6 434 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 OR8D4Q8NGM9 314 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC7A6Q92536 515 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 MACROD1Q9BQ69 325 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ISYNA1Q9NPH2 558 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 PGRMC2O15173 223 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 CASC3O15234 703 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 CLEC3AO75596 197 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 CLTBP09497 229 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 MYL9P24844 172 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 NTSP30990 170 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 RACK1P63244 317 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF750Q32MQ0 723 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 MINDY4Q4G0A6 757 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 SFTPA1Q8IWL2 248 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC116Q8IYX3 515 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFP41Q8N8Y5 198 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 CNIH4Q9P003 139 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 COMMD3Q9UBI1 195 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNE3Q9Y6H6 103 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0G2JPF8 293 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 PCCBP05166 539 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CD79BP40259 229 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 KIR2DL3P43628 341 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TAS2R41P59536 307 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 GNA13Q14344 377 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 MRGPREQ86SM8 312 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 LHFPL3Q86UP9 236 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ZG16BQ96DA0 208 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 C16orf58Q96GQ5 468 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 FRMD6Q96NE9 622 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 FAIM2Q9BWQ8 316 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 COL4A3Q01955 1670 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC35G4P0C7Q5 338 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CCL5P13501 91 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CDK3Q00526 305 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC9A5Q14940 896 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 BHLHB9Q6PI77 547 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC38A2Q96QD8 506 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 PINK1Q9BXM7 581 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CHD7Q9P2D1 2997 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 FRS3O43559 492 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 EFCAB14O75071 495 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 P2RY2P41231 377 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP2R2DQ66LE6 453 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFYVE19Q96K21 471 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF121Q9H920 327 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 WDR70Q9NW82 654 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 UBXN7O94888 489 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 APEX1P27695 318 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM64Q6YI46 380 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF485Q8NCK3 441 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms