RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474082.1

FAM3C-204, Transcript of family with sequence similarity 3 member C, human

TSL 2

Gene FAM3C, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM3C-204	ENST00000474082	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082		A0A0U1RQV5	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ACOD1	A6NK06	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	PDLIM1	O00151	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	IMPA2	O14732	288 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	CHAD	O15335	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	TOM1L1	O75674	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	PDE5A	O76074	875 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	MT-ND1	P03886	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	MTTP	P55157	894 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	PRKCE	Q02156	737 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	HSF2	Q03933	536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	SRY	Q05066	204 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ACER2	Q5QJU3	275 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	POLE3	Q9NRF9	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	LRIT2	A6NDA9	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082		H0YL77	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	SMPD2	O60906	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	SDC3	O75056	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	VPS26A	O75436	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	DIRAS3	O95661	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	IGSF6	O95976	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	IFNB1	P01574	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	MFAP2	P55001	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ZP4	Q12836	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	MISP	Q8IVT2	679 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	RASL10A	Q92737	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	CUX2	O14529	1486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	E2F3	O00716	465 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ALOX15B	O15296	676 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	HMMR	O75330	724 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	VENTX	O95231	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	CA3	P07451	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	TSPAN8	P19075	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	BNIP1	Q12981	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	LPAL2	Q16609	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082		U3KQV3	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-204	ENST00000474082	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-204	ENST00000474082	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-204	ENST00000474082		H3BTX0	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-204	ENST00000474082	CRLF1	O75462	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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