RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433271.6

TMEM248-205, Transcript of transmembrane protein 248, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM248, Length 1,610 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248-205ENST00000433271 XAGE5Q8WWM1 108 aa24.6■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 SLC9A6Q92581 669 aa24.6■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 MAL2Q969L2 176 aa24.6■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 MUC13Q9H3R2 512 aa24.6■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 FOLH1BQ9HBA9 442 aa24.6■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 A4GALTQ9NPC4 353 aa24.6■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 GIN1Q9NXP7 522 aa24.6■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 EGFL7Q9UHF1 273 aa24.6■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 SOCS6O14544 535 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 ACOT8O14734 319 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 FBXO30Q8TB52 745 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 NCLNQ969V3 563 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 SLC35A4Q96G79 324 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 STACQ99469 402 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 SEMA4CQ9C0C4 833 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 PIGUQ9H490 435 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 DUSP22Q9NRW4 184 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 ALOX5P09917 674 aa24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 ACP2P11117 423 aa24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 COX6A1P12074 109 aa24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 VEZF1Q14119 521 aa24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 MYBPC3Q14896 1274 aa24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 PCOLCEQ15113 449 aa24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 TGIF1Q15583 401 aa24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 TBC1D25Q3MII6 688 aa24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 C1orf146Q5VVC0 180 aa24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 OR11G2Q8NGC1 345 aa24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 SNX13Q9Y5W8 968 aa24.58■■□□□ 1.53
TMEM248-205ENST00000433271 TTC36A6NLP5 189 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 OR6C76A6NM76 312 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 GSTA4O15217 222 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 TFPTP0C1Z6 253 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 ARAFP10398 606 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 GGT1P19440 569 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 SPINK2P20155 84 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 OTX2P32243 289 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 PCGF2P35227 344 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 CORO7P57737 925 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 SLC26A5P58743 744 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 CDK6Q00534 326 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 DUSP5Q16690 384 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 ATAD3BQ5T9A4 648 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 APCDD1LQ8NCL9 501 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 SLC38A5Q8WUX1 472 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 EXD2Q9NVH0 621 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 ACTR3BQ9P1U1 418 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 P2RX2Q9UBL9 471 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 IL17BQ9UHF5 180 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 DTX4Q9Y2E6 619 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 NKX2-2O95096 273 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 PSG6Q00889 435 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 NDUFAF7Q7L592 441 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 DHFR2Q86XF0 187 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 PROSER1Q86XN7 944 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 METTL25Q8N6Q8 603 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 WDR60Q8WVS4 1066 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 VMP1Q96GC9 406 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 IMMP1LQ96LU5 166 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 LIPT1Q9Y234 373 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 KCNE3Q9Y6H6 103 aa24.57■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 TMEM247A6NEH6 219 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 ARPC2O15144 300 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 GMNNO75496 209 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 NCK1P16333 377 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 GABRA3P34903 492 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 SCARB2Q14108 478 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 FLOT2Q14254 428 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 GLYATQ6IB77 296 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 SLC30A8Q8IWU4 369 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 GPR151Q8TDV0 419 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 CDS1Q92903 461 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 VPS50Q96JG6 964 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 MSRB2Q9Y3D2 182 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa24.55■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 CXCR6O00574 342 aa24.55■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 CREG1O75629 220 aa24.55■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 STAMBPO95630 424 aa24.55■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 DMTNQ08495 405 aa24.55■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 IL10RAQ13651 578 aa24.55■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 GNA13Q14344 377 aa24.55■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 EXT1Q16394 746 aa24.55■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 C9orf40Q8IXQ3 194 aa24.55■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 NFKBIDQ8NI38 313 aa24.55■■□□□ 1.52
TMEM248-205ENST00000433271 FIG4Q92562 907 aa24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 184.6 ms