RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 MAB21L2Q9Y586 359 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HYKKA2RU49 373 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 BTN3A1O00481 513 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HRO43593 1189 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SEMG1P04279 462 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGDIBP52566 201 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ATG9BQ674R7 924 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SUSD1Q6UWL2 747 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 OR4N4Q8N0Y3 316 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CHST14Q8NCH0 376 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PDXPQ96GD0 296 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 COQ10AQ96MF6 247 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SERHLQ9NQF3 203 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 LANCL1O43813 399 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CCNDBP1O95273 360 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CTSEP14091 401 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF91Q05481 1191 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 DSG2Q14126 1118 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 LPAL2Q16609 132 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PLAG1Q6DJT9 500 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ASB18Q6ZVZ8 466 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ADIPOR2Q86V24 386 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MYEOVQ96EZ4 313 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 KCNJ15Q99712 375 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 BCL2L14Q9BZR8 327 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 STUB1Q9UNE7 303 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MGAT4BQ9UQ53 548 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 FPGTO14772 594 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 FFAR3O14843 346 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 GPR42O15529 346 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HCN1O60741 890 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MMP20O60882 483 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFS3O75489 264 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SEMA4FO95754 770 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HMGN1P05114 100 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ITGB7P26010 798 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 AQP1P29972 269 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ITGA1P56199 1179 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 STARD6P59095 220 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ARF5P84085 180 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HSF2Q03933 536 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CAMK2DQ13557 499 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MANEALQ5VSG8 457 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SYT13Q7L8C5 426 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC36Q8IYA8 594 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 DPY30Q9C005 99 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CHRDQ9H2X0 955 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 OR51B5Q9H339 312 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 COPZ2Q9P299 210 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MED16Q9Y2X0 877 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0C4DFX4 3053 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TPST2O60704 377 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 RPP40O75818 363 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 LPLP06858 475 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 FNTBP49356 437 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CENPAP49450 140 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 S100A12P80511 92 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ABRQ12979 859 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SPHARQ15513 63 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MICAQ29983 383 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 RBFAQ8N0V3 343 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 BEST4Q8NFU0 473 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 OR2T4Q8NH00 348 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 IL4I1Q96RQ9 567 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB18Q99592 522 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 DPH7Q9BTV6 452 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms