RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM77I1YAP6 450 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 TCAPO15273 167 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 CACNG3O60359 315 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ZBTB37Q5TC79 503 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF585AQ6P3V2 769 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 PMM1Q92871 262 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 SLC35A5Q9BS91 424 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa13.71□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF878C9JN71 531 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 SF1Q15637 639 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ADAM5Q6NVV9 412 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 PXKQ7Z7A4 578 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 TMPRSS11BQ86T26 416 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 MS4A15Q8N5U1 240 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 RNF141Q8WVD5 230 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 METTL21AQ8WXB1 218 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 OCSTAMPQ9BR26 566 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 NOX3Q9HBY0 568 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 KLK4Q9Y5K2 254 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 LTN1O94822 1766 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 C10orf71Q711Q0 1435 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 SEC14L5O43304 696 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ADGRF1Q5T601 910 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 CMIPQ8IY22 773 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 OR6V1Q8N148 313 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 SORCS1Q8WY21 1168 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 OTUB2Q96DC9 234 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 SLC35G5Q96KT7 338 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 DOHHQ9BU89 302 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 SMOC2Q9H3U7 446 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 HHATLQ9HCP6 504 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 FAAHO00519 579 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 GOT2P00505 430 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 EPHX1P07099 455 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 IL1R2P27930 398 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 PPT1P50897 306 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 DIO3P55073 304 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 UBE2KP61086 200 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 LILRA2Q8N149 483 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 CFAP52Q8N1V2 620 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 BORCS6Q96GS4 357 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF98A6NK75 572 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 DUXAA6NLW8 204 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 HPGDSO60760 199 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 VNN1O95497 513 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 C8AP07357 584 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ELNP15502 786 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 SPI1P17947 270 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 RPS19P39019 145 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 PSMD8P48556 350 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 INCA1Q0VD86 236 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 CLLU1Q5K131 121 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF852Q6ZMS4 543 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 C16orf58Q96GQ5 468 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 SFXN2Q96NB2 322 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 LRFN5Q96NI6 719 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 PIP5K1AQ99755 562 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 CCM2Q9BSQ5 444 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ALPIP09923 528 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 RAB30Q15771 203 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 CYS1Q717R9 158 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 CACUL1Q86Y37 369 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ESAMQ96AP7 390 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 PLEKHA1Q9HB21 404 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 MED31Q9Y3C7 131 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 INSL6Q9Y581 213 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 CORINQ9Y5Q5 1042 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 PHLPP1O60346 1717 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 CALCRP30988 508 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ASAH1Q13510 395 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 CEP68Q76N32 757 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 DBF4BQ8NFT6 615 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 NFKBIDQ8NI38 313 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 SLC6A7Q99884 636 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ARNT2Q9HBZ2 717 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 AIG1Q9NVV5 245 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ABI3Q9P2A4 366 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1B0GV50 99 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 MYBPHLA2RUH7 354 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 SLC16A8O95907 504 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 SMIM6P0DI80 62 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PTPRO-201ENST00000281171 IVDP26440 423 aa13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms