RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hsfy2Q80Y37 392 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rbm11Q80YT9 238 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atg4dQ8BGV9 474 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc126Q8BIS8 140 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cox15Q8BJ03 413 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hmbox1Q8BJA3 419 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxo30Q8BJL1 746 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PgghgQ8BP56 690 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pomgnt2Q8BW41 605 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Casc3Q8K3W3 698 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Angptl7Q8R1Q3 337 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NclnQ8VCM8 563 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ogfrl1Q8VE52 464 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr881Q8VF63 314 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr347Q8VGK2 312 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc15a4Q91W98 574 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdhb16Q91Y03 802 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mtif2Q91YJ5 727 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem159Q922Z1 161 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ifi44lQ9BDB7 447 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tex46Q9CPU3 165 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnase1l2Q9D1G0 278 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zdhhc21Q9D270 265 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Toe1Q9D2E2 511 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ift43Q9DA69 206 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r52Q9EP79 309 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ing1Q9QXV3 279 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CtszQ9WUU7 306 aa8.73□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cfap54Q8C6S9 3106 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cacna1dQ99246 2179 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm4869A0A1B0GSG7 984 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm13539A0A1B0GSM6 183 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rhox1B1APN4 224 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klhl3E0CZ16 587 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Btbd2E9PUS2 523 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighg2cF6TQW2 404 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp275G3X904 499 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FpgtG5E8F4 590 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r13L7N1X2 831 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxw15L7N1X6 466 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r93L7N1Z9 857 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 B3galt2O54905 422 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01637 128 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01864 335 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ArafP04627 604 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fabp1P12710 127 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc2a2P14246 523 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gria1P23818 907 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Impdh2P24547 514 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Thbs1P35441 1170 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nat3P50296 290 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Idh2P54071 452 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nup43P59235 380 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sem1P60897 70 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cuzd1P70412 606 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gbx1P82976 418 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 C1qaP98086 245 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 VldlrP98156 873 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mmp7Q10738 264 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lemd1Q14C37 129 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdr20Q3UWE6 569 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ripk1Q60855 656 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sh3gl3Q62421 347 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AktipQ64362 292 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Egfl8Q6GUQ1 293 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tha1Q6XPS7 400 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cd3eapQ76KJ5 399 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr591Q7TRR7 314 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Btnl1Q7TST0 509 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atg4bQ8BGE6 393 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam210aQ8BGY7 273 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxl4Q8BH70 621 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zcchc3Q8BPK2 400 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Peli2Q8BST6 419 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam46bQ8C152 427 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SinhcafQ8C8M1 221 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 N4bp2l2Q8JZS6 575 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fmo2Q8K2I3 535 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ffar2Q8VCK6 330 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FggQ8VCM7 436 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr394Q8VGR5 310 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdhr1Q8VHP6 859 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrgpra7Q91ZC5 305 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SmoxQ99K82 555 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psat1Q99K85 370 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmp1Q99KU0 406 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abcg5Q99PE8 652 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ncbp2Q9CQ49 156 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PglsQ9CQ60 257 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q9CQM1 111 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zswim7Q9CWQ2 152 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spaca7Q9D2S4 182 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chp2Q9D869 196 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Clec3aQ9EPW4 196 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Jph1Q9ET80 660 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Alms1Q8K4E0 3251 aa8.72□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdfy4E9Q2M9 3149 aa8.71□□□□□ -1.01
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm7682A0A0J9YUM1 481 aa8.71□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr625-ps1A0A140T8L4 321 aa8.71□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm13723A0A1L1SUP2 315 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.8 ms