Protein–RNA interactions for Protein: Q10738

Mmp7, Matrilysin, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp7Q10738 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Mmp7Q10738 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Mmp7Q10738 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Mmp7Q10738 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Mmp7Q10738 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Mmp7Q10738 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Mmp7Q10738 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Mmp7Q10738 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Mmp7Q10738 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Mmp7Q10738 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Mmp7Q10738 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Mmp7Q10738 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Mmp7Q10738 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Mmp7Q10738 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Mmp7Q10738 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Mmp7Q10738 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Mmp7Q10738 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Mmp7Q10738 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Mmp7Q10738 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Mmp7Q10738 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Mmp7Q10738 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Mmp7Q10738 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Mmp7Q10738 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Mmp7Q10738 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Mmp7Q10738 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Mmp7Q10738 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mmp7Q10738 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Mmp7Q10738 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Mmp7Q10738 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Mmp7Q10738 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mmp7Q10738 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Mmp7Q10738 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Mmp7Q10738 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Mmp7Q10738 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Mmp7Q10738 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mmp7Q10738 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mmp7Q10738 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Mmp7Q10738 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mmp7Q10738 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mmp7Q10738 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mmp7Q10738 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mmp7Q10738 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mmp7Q10738 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mmp7Q10738 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mmp7Q10738 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Mmp7Q10738 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mmp7Q10738 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mmp7Q10738 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mmp7Q10738 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mmp7Q10738 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Mmp7Q10738 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mmp7Q10738 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mmp7Q10738 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mmp7Q10738 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mmp7Q10738 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mmp7Q10738 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mmp7Q10738 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Mmp7Q10738 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mmp7Q10738 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mmp7Q10738 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mmp7Q10738 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mmp7Q10738 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Mmp7Q10738 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mmp7Q10738 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mmp7Q10738 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mmp7Q10738 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mmp7Q10738 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mmp7Q10738 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mmp7Q10738 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mmp7Q10738 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mmp7Q10738 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mmp7Q10738 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mmp7Q10738 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mmp7Q10738 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mmp7Q10738 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Mmp7Q10738 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mmp7Q10738 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mmp7Q10738 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mmp7Q10738 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mmp7Q10738 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mmp7Q10738 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mmp7Q10738 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mmp7Q10738 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mmp7Q10738 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mmp7Q10738 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp7Q10738 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp7Q10738 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp7Q10738 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mmp7Q10738 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mmp7Q10738 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mmp7Q10738 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Mmp7Q10738 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mmp7Q10738 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mmp7Q10738 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mmp7Q10738 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Mmp7Q10738 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mmp7Q10738 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mmp7Q10738 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mmp7Q10738 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Mmp7Q10738 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.5 ms