RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 EPXP11678 715 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 CPMP14384 443 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 CTSSP25774 331 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 DGKQP52824 942 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 TOMM20Q15388 145 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 DCST1Q5T197 706 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 PAMR1Q6UXH9 720 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 CAMKMTQ7Z624 323 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 KIF18BQ86Y91 864 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 OR52B6Q8NGF0 335 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 RAB17Q9H0T7 212 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 CALHM2Q9HA72 323 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 DLL4Q9NR61 685 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 FETUBQ9UGM5 382 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM29Q9UKF5 820 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 MED12Q93074 2177 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 CDH16O75309 829 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 PORP16435 677 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 NAGAP17050 411 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 NT5EP21589 574 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 GPX3P22352 226 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 PTPN6P29350 595 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 NAGLUP54802 743 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 FRG2Q64ET8 278 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 FRG2BQ96QU4 278 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 JKAMPQ9P055 326 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 DTX4Q9Y2E6 619 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 EXPH5Q8NEV8 1989 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 GNB5O14775 395 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 IL18BPO95998 194 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 KRT15P19012 456 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 TYK2P29597 1187 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 OPRM1P35372 400 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM8P78325 824 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 SORDQ00796 357 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 TECRLQ5HYJ1 363 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM81Q6P7N7 255 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 OR1J4Q8NGS1 313 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 DOCK7Q96N67 2140 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 NTMT1Q9BV86 223 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 METTL7AQ9H8H3 244 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 AHSPQ9NZD4 102 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 CES1P1Q9UKY3 287 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 PPM1BO75688 479 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 FOSL1P15407 271 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINB8P50452 374 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 CCNG1P51959 295 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 MGAT2Q10469 447 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 PAGE2Q7Z2X7 111 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 VWA5B2Q8N398 1253 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 LINC01560Q8TB33 94 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ZPLD1Q8TCW7 415 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ACTL6AO96019 429 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 RAF1P04049 648 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 MAP4K2Q12851 820 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 DESI1Q6ICB0 168 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 SLC48A1Q6P1K1 146 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 NUP54Q7Z3B4 507 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 METTL4Q8N3J2 472 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 C9orf106Q8NAJ2 232 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 TRPC4APQ8TEL6 797 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 HGDQ93099 445 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 PHF21BQ96EK2 531 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 VPS11Q9H270 941 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB26Q9HCK0 441 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 CFL2Q9Y281 166 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ATE1O95260 518 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 CPN1P15169 458 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 SOX18P35713 384 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 MAPK12P53778 367 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 IFT88Q13099 833 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 TRAF3Q13114 568 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 RCAN2Q14206 197 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms