RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 CROCCQ5TZA2 2017 aa15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 CREBBPQ92793 2442 aa15.75■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1B0GTH9 108 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR14I1A6ND48 311 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC28A1O00337 649 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACOX3O15254 700 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPHS1O60500 1241 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLITRK5O94991 958 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHG3P01860 377 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEFHP12036 1026 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAGAP17050 411 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDCP20711 480 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPX3P22352 226 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRPH2P23942 346 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 MPIP34949 423 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNASE1L1P49184 302 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSPHP78330 225 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 BTKQ06187 659 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEBPEQ15744 281 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCIMPQ6UWF3 145 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 IKBIPQ70UQ0 350 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 FGD2Q7Z6J4 655 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRGPRGQ86SM5 289 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 DOLPP1Q86YN1 238 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR10G3Q8NGC4 313 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR52N2Q8NGI0 321 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSPBAP1Q96EW2 488 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM111AQ96PZ2 611 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYNNQ9NPC7 610 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 QPCTLQ9NXS2 382 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCAP29Q9UHQ4 241 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 GTF3C1Q12789 2109 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM166BA8MTA8 275 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 G3V3Y1 287 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 AZIN1O14977 448 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 RGS14O43566 566 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUSD5O60279 629 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 SERPINB5P36952 375 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIGAP37287 484 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM111BQ6SJ93 734 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM251Q8N6I4 163 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 EBPLQ9BY08 206 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 PARD6BQ9BYG5 372 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEFB127Q9H1M4 99 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFP64Q9NPA5 681 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 B4GALT7Q9UBV7 327 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB21Q9UL25 225 aa15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 V9GYY5 206 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1B0GVC2 190 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCKDKO14874 412 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNX4O95219 450 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 CBX7O95931 251 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 TPOP07202 933 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 FGF4P08620 206 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCD3P28288 659 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALDH3A1P30838 453 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAGEA5P43359 124 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPICP45877 212 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 DUSP2Q05923 314 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 C2orf80Q0P641 193 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC10A1Q14973 349 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF628Q5EBL2 1059 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAMEF20Q5VT98 475 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF787Q6DD87 383 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM71E1Q6IPT2 247 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 NOXRED1Q6NXP6 359 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM81Q6P7N7 255 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD163Q86VB7 1156 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC116Q8IYX3 515 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM9CQ8IZT9 166 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADCY4Q8NFM4 1077 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCP10LQ8TDR4 215 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 DIO2Q92813 273 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF597Q96LX8 424 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 DMRTA2Q96SC8 542 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 DOHHQ9BU89 302 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 MIEF1Q9NQG6 463 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 C1orf109Q9NX04 203 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCL27Q9Y4X3 112 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 CACNA1DQ01668 2161 aa15.72■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLOD3O60568 738 aa15.71■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 HCN1O60741 890 aa15.71■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEC22BO75396 215 aa15.71■□□□□ 0.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPM1BO75688 479 aa15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms