RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493507.5

CCNB3-208, Transcript of cyclin B3, human

TSL 1 (best)

Gene CCNB3, Length 340 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB3-208	ENST00000493507	ABCD3	P28288	659 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	ACADL	P28330	430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CBS	P35520	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	GABRA4	P48169	554 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	LIMK2	P53671	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	ABAT	P80404	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	ABR	Q12979	859 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	ZIC1	Q15915	447 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CCNG2	Q16589	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	NAT6	Q93015	286 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	IL17F	Q96PD4	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CTRC	Q99895	268 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	P2RY12	Q9H244	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	XKR8	Q9H6D3	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	ASB8	Q9H765	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	SEC16A	O15027	2179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507		A8MU76	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507		H3BMH7	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	BTN3A3	O00478	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	KCNAB3	O43448	404 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	VEGFD	O43915	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	NIPSNAP2	O75323	286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	PIAS1	O75925	651 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CDK14	O94921	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	KRT14	P02533	472 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	APRT	P07741	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	TPSB2	P20231	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	ITGAX	P20702	1163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CCR7	P32248	378 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	BDKRB1	P46663	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CAPZB	P47756	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	HTR6	P50406	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	EFNA3	P52797	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	MPP1	Q00013	466 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	EGR4	Q05215	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CDH17	Q12864	832 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	HNF4G	Q14541	408 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	CENPU	Q71F23	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNB3-208	ENST00000493507	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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