RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487064.1

RPS3AP50-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 50, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP50, Length 803 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP50-201ENST00000487064 TMEM163Q8TC26 289 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 BRSK1Q8TDC3 778 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 DDI1Q8WTU0 396 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 NAT14Q8WUY8 206 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 TWIST2Q8WVJ9 160 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLCO4A1Q96BD0 722 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 ROPN1LQ96C74 230 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 ASB9Q96DX5 294 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 C19orf60Q96EN9 201 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 SPATA17Q96L03 361 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 CNBD2Q96M20 576 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 HARBI1Q96MB7 349 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 NSMCE3Q96MG7 304 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 TRIB3Q96RU7 358 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 SH3GL3Q99963 347 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 MGME1Q9BQP7 344 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 SPATA16Q9BXB7 569 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 ERVK-6Q9BXR3 956 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLC2A11Q9BYW1 496 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 DERL2Q9GZP9 239 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF696Q9H7X3 374 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 COQ10BQ9H8M1 238 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 SYTL2Q9HCH5 934 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 MAGEE1Q9HCI5 957 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 VCX3AQ9NNX9 186 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 TMEM161AQ9NX61 479 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 UBAP1Q9NZ09 502 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 SELENONQ9NZV5 590 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 MSRB1Q9NZV6 116 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 GIMAP2Q9UG22 337 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 IKZF3Q9UKT9 509 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 TMCO1Q9UM00 188 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 AP4S1Q9Y587 144 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 ARL5AQ9Y689 179 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 A3GALT2U3KPV4 340 aa3.59□□□□□ -1.83
RPS3AP50-201ENST00000487064 MYO9BQ13459 2157 aa3.59□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 A0A0D9SEW6 157 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 A0A0J9YYE9 177 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 H3BMM5 538 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 FXYD1O00168 92 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 CDC7O00311 574 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 NME4O00746 187 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 ANGPT2O15123 496 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 HS6ST1O60243 411 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 KLK8O60259 260 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 KERAO60938 352 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 VPS26AO75436 327 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 ECI2O75521 394 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 ATP6AP2O75787 350 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 OR6B1O95007 311 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 GJB5O95377 273 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 TNFAIP8O95379 198 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 PGM3O95394 542 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 CLPTM1O96005 669 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 TFAP2AP05549 437 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 RB1P06400 928 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 RHOCP08134 193 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 RPS17P08708 135 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 LINC00032P0C843 101 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 TFPIP10646 304 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 ETFAP13804 333 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 HSD17B1P14061 328 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 PSMC3P17980 439 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 AGAP20933 346 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 ATP6V1B2P21281 511 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 CD9P21926 228 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 MYF6P23409 242 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 CALRP27797 417 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 CHATP28329 748 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 RPL5P46777 297 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 RGRP47804 291 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLC11A1P49279 550 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 F2RL1P55085 397 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 CDH4P55283 916 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 FOXA1P55317 472 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 NME5P56597 212 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 ECT2LQ008S8 904 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 PRKCZQ05513 592 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 FAM27E3Q08E93 113 aa3.58□□□□□ -1.84
RPS3AP50-201ENST00000487064 SMARCB1Q12824 385 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms