RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 FANCEQ9HB96 536 aa21.78■■□□□ 1.08
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FAAP20-209ENST00000428120 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-209ENST00000428120 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-209ENST00000428120 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-209ENST00000428120 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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FAAP20-209ENST00000428120 MS4A12Q9NXJ0 267 aa21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-209ENST00000428120 BLOC1S6Q9UL45 172 aa21.78■■□□□ 1.08
FAAP20-209ENST00000428120 CDC14AQ9UNH5 594 aa21.78■■□□□ 1.08
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FAAP20-209ENST00000428120 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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FAAP20-209ENST00000428120 PCSK6P29122 969 aa21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-209ENST00000428120 SLC5A2P31639 672 aa21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-209ENST00000428120 MAN2A2P49641 1150 aa21.77■■□□□ 1.08
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FAAP20-209ENST00000428120 SLC16A11Q8NCK7 471 aa21.77■■□□□ 1.08
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FAAP20-209ENST00000428120 MIPOL1Q8TD10 442 aa21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-209ENST00000428120 RASSF5Q8WWW0 418 aa21.77■■□□□ 1.08
FAAP20-209ENST00000428120 ZG16BQ96DA0 208 aa21.77■■□□□ 1.08
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FAAP20-209ENST00000428120 FGF17O60258 216 aa21.77■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 RDH16O75452 317 aa21.77■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa21.77■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.77■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 OR9A4Q8NGU2 314 aa21.77■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 SLC38A3Q99624 504 aa21.77■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 MAP3K3Q99759 626 aa21.77■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 SLC24A3Q9HC58 644 aa21.77■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 LYRM4Q9HD34 91 aa21.77■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 BCL2L10Q9HD36 194 aa21.77■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa21.77■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa21.77■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 EPPINO95925 133 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 CHRNEQ04844 493 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 COLEC12Q5KU26 742 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 XAF1Q6GPH4 301 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 SPARTQ8N0X7 666 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 SLC9A6Q92581 669 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC90BQ9GZT6 254 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 UCKL1Q9NWZ5 548 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.76■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHGA12O60330 932 aa21.75■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 SOX18P35713 384 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 FASLGP48023 281 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 SEC23BQ15437 767 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 C16orf62Q7Z3J2 963 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 CA13Q8N1Q1 262 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 MPP4Q96JB8 637 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 HRASLS5Q96KN8 279 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 PITX2Q99697 317 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 ACTRT3Q9BYD9 372 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 RBCK1Q9BYM8 510 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF556Q9HAH1 456 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 CTPS2Q9NRF8 586 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 POFUT2Q9Y2G5 429 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 CYR61O00622 381 aa21.75■■□□□ 1.07
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FAAP20-209ENST00000428120 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 MFSD12Q6NUT3 480 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 USP53Q70EK8 1073 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 NLGN4XQ8N0W4 816 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 ADAMTS15Q8TE58 950 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 SLC35A4Q96G79 324 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 MS4A4EQ96PG1 132 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 NELL2Q99435 816 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 SLC38A1Q9H2H9 487 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 CHRDQ9H2X0 955 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 CEP192Q8TEP8 1941 aa21.75■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 AQP9O43315 295 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 FCMRO60667 390 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 PROS1P07225 676 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 GABARAPL2P60520 117 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 GPR107Q5VW38 600 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 IQCHQ86VS3 1027 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 ENTHD1Q8IYW4 607 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 OR6T1Q8NGN1 323 aa21.74■■□□□ 1.07
FAAP20-209ENST00000428120 CDS1Q92903 461 aa21.74■■□□□ 1.07
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