RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TIMP3P35625 211 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 DLX5P56178 289 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 MGAT2Q10469 447 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 MYBPHQ13203 477 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM64Q6YI46 380 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 LCA5Q86VQ0 697 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM200AQ86VY9 491 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 LACC1Q8IV20 430 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 SELENOMQ8WWX9 145 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 CTHRC1Q96CG8 243 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 HSPBAP1Q96EW2 488 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 TIMP4Q99727 224 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 MAT2BQ9NZL9 334 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 PSME2Q9UL46 239 aa19.21■□□□□ 0.67
LIMS1-208ENST00000428064 NINQ8N4C6 2090 aa19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 ACOX3O15254 700 aa19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 PPM1BO75688 479 aa19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
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LIMS1-208ENST00000428064 TRPC1P48995 793 aa19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 BICRALQ6AI39 1079 aa19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 VASNQ6EMK4 673 aa19.2■□□□□ 0.66
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LIMS1-208ENST00000428064 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 MNS1Q8NEH6 495 aa19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 TM4SF18Q96CE8 201 aa19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 FETUBQ9UGM5 382 aa19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF225Q9UK10 706 aa19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 DTX4Q9Y2E6 619 aa19.2■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 PPP6CO00743 305 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 ZWINTO95229 277 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD2P08910 425 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 RHOXF2BP0C7M4 288 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 KRT15P19012 456 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 DEKP35659 375 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 SOX18P35713 384 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 SNTA1Q13424 505 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 SGO1Q5FBB7 561 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 LGSNQ5TDP6 509 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 TIGD3Q6B0B8 471 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 TIFABQ6ZNK6 161 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 IFT81Q8WYA0 676 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 GNRHR2Q96P88 292 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 FAIM2Q9BWQ8 316 aa19.19■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 SYT5O00445 386 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 DVL2O14641 736 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 TRAPPC6AO75865 159 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 CD1EP15812 388 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 PTPN6P29350 595 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 HSD17B3P37058 310 aa19.18■□□□□ 0.66
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LIMS1-208ENST00000428064 CDH13P55290 713 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 DCAF7P61962 342 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 CLCQ05315 142 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 RASA2Q15283 850 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 SLC30A6Q6NXT4 461 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 NUP54Q7Z3B4 507 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 PRR22Q8IZ63 422 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 NAXEQ8NCW5 288 aa19.18■□□□□ 0.66
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LIMS1-208ENST00000428064 KLHL29Q96CT2 875 aa19.18■□□□□ 0.66
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LIMS1-208ENST00000428064 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF681Q96N22 645 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF382Q96SR6 550 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 SH3GL2Q99962 352 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 ITPAQ9BY32 194 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 BRINP2Q9C0B6 783 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 VPS29Q9UBQ0 182 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 PRODH2Q9UF12 536 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 MCM8Q9UJA3 840 aa19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa19.17■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 CD8B2A6NJW9 211 aa19.17■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 TO15178 435 aa19.17■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 CTAG2O75638 210 aa19.17■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 OR4F21O95013 312 aa19.17■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 CBX7O95931 251 aa19.17■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 TAC1P20366 129 aa19.17■□□□□ 0.66
LIMS1-208ENST00000428064 FEN1P39748 380 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
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