RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
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RABGGTA-201ENST00000216840 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 DEFB133Q30KQ1 61 aa16.17■□□□□ 0.18
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RABGGTA-201ENST00000216840 TCTN3Q6NUS6 607 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
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RABGGTA-201ENST00000216840 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa16.17■□□□□ 0.18
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RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF628Q5EBL2 1059 aa16.16■□□□□ 0.18
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RABGGTA-201ENST00000216840 DEF8Q6ZN54 512 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM92BQ6ZTR7 304 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
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RABGGTA-201ENST00000216840 LIPT1Q9Y234 373 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 POFUT2Q9Y2G5 429 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 RDH16O75452 317 aa16.15■□□□□ 0.18
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RABGGTA-201ENST00000216840 GPR141Q7Z602 305 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 OR9A4Q8NGU2 314 aa16.15■□□□□ 0.18
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RABGGTA-201ENST00000216840 CDC73Q6P1J9 531 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 ADAMTS15Q8TE58 950 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 TANKQ92844 425 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 TCTN2Q96GX1 697 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 SIT1Q9Y3P8 196 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-201ENST00000216840 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 M0R3H8 397 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-201ENST00000216840 PIAS2O75928 621 aa16.14■□□□□ 0.17
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