RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pld3O35405 488 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc11a1P41251 548 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Stox2Q499E5 926 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 HlxQ61670 476 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmeff1Q6PFE7 372 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zar1Q80SU3 361 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Adgrg7Q8BM96 785 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prkd2Q8BZ03 875 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Wdr74Q8VCG3 384 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Uhrf1Q8VDF2 782 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spata19Q9DAQ9 154 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MyotQ9JIF9 496 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prl5a1Q9JII2 230 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Atrnl1Q6A051 1378 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SmoktcrA2KF29 484 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sac3d1A6H687 427 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ComtO88587 265 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Igh-1aP01865 398 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Drd3P30728 446 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Chrm4P32211 479 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Acot8P58137 320 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Arpc4P59999 168 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PtnP63089 168 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cnn2Q08093 305 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 FcrlbQ5DRQ8 427 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 RgnQ64374 299 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BC061212Q6P8K3 481 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ugt2a3Q8BWQ1 534 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q8CF31 99 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Recql5Q8VID5 982 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Txndc17Q9CQM5 123 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r40Q9EQ46 310 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tuba8Q9JJZ2 449 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kcnd3Q9Z0V1 655 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Syngr4Q9Z1L2 233 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm5938A2AEN9 163 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cilp2D3Z7H8 1162 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Acbd4E9Q289 327 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mmp11Q02853 492 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Agbl5Q09M02 886 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Isg20l2Q3U1G5 368 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r196Q5SVD5 301 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 A4galtQ67BJ4 359 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dpp10Q6NXK7 797 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf182Q6P560 627 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BpifcQ8C186 509 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sacm1lQ9EP69 587 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gsk3bQ9WV60 420 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1032A2ATE5 310 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TtkP35761 856 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Grik2P39087 908 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Polr1cP52432 346 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Aqp4P55088 323 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpat2Q14DK4 801 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CdonQ32MD9 1250 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mex3dQ3UE17 643 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Csnk2a1Q60737 391 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Clec18aQ7TSQ1 534 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Wdr92Q8BGF3 357 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Clrn3Q8BHH8 226 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Peli2Q8BST6 419 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Egln2Q91YE2 419 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mthfd1Q922D8 935 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Serinc1Q9QZI8 453 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hoxd12P23812 268 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tnfrsf1bP25119 474 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdh26P59862 763 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q3U6N9 222 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ankrd13bQ5F259 626 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Actr3bQ641P0 418 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Opn5Q6VZZ7 377 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Leng9Q8BTN6 485 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Asrgl1Q8C0M9 326 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1Q8VGI1 314 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cwh43Q91YL7 699 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 OptcQ920A0 328 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Emc3Q99KI3 261 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Myh3P13541 1940 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Peak1Q69Z38 1735 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4931429L15RikE9PVU2 379 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Csf1P07141 552 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 F3P20352 294 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Syt4P40749 425 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Npbwr1P49681 329 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dcaf7P61963 342 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tra2bP62996 288 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rack1P68040 317 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Amz2Q400C8 359 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dag1Q62165 893 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccdc117Q6PB51 277 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Il17fQ7TNI7 161 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defb14Q7TNV9 67 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slitrk4Q810B8 837 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc46a2Q8CA03 479 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SuoxQ8R086 546 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AcmsdQ8R519 336 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Marc2Q922Q1 338 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Otub2Q9CQX0 234 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fundc1Q9DB70 155 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mfsd1Q9DC37 464 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.5 ms