Protein–RNA interactions for Protein: Q62165

Dag1, Dystroglycan, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dag1Q62165 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Dag1Q62165 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dag1Q62165 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Dag1Q62165 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Dag1Q62165 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Dag1Q62165 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Dag1Q62165 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Dag1Q62165 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Dag1Q62165 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Dag1Q62165 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Dag1Q62165 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Dag1Q62165 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Dag1Q62165 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Dag1Q62165 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dag1Q62165 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Dag1Q62165 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Dag1Q62165 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Dag1Q62165 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dag1Q62165 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dag1Q62165 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Dag1Q62165 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Dag1Q62165 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dag1Q62165 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dag1Q62165 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dag1Q62165 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dag1Q62165 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Dag1Q62165 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dag1Q62165 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Dag1Q62165 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Dag1Q62165 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Dag1Q62165 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Dag1Q62165 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dag1Q62165 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dag1Q62165 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dag1Q62165 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dag1Q62165 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dag1Q62165 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Dag1Q62165 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dag1Q62165 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dag1Q62165 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dag1Q62165 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dag1Q62165 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dag1Q62165 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dag1Q62165 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dag1Q62165 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dag1Q62165 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dag1Q62165 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dag1Q62165 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dag1Q62165 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dag1Q62165 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Dag1Q62165 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dag1Q62165 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Dag1Q62165 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Dag1Q62165 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dag1Q62165 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Dag1Q62165 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Dag1Q62165 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Dag1Q62165 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dag1Q62165 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dag1Q62165 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dag1Q62165 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dag1Q62165 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Dag1Q62165 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dag1Q62165 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dag1Q62165 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Dag1Q62165 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dag1Q62165 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dag1Q62165 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dag1Q62165 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dag1Q62165 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dag1Q62165 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Dag1Q62165 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dag1Q62165 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dag1Q62165 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dag1Q62165 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dag1Q62165 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Dag1Q62165 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dag1Q62165 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dag1Q62165 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dag1Q62165 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dag1Q62165 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dag1Q62165 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Dag1Q62165 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Dag1Q62165 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dag1Q62165 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dag1Q62165 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dag1Q62165 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Dag1Q62165 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dag1Q62165 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dag1Q62165 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dag1Q62165 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dag1Q62165 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dag1Q62165 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dag1Q62165 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dag1Q62165 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dag1Q62165 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dag1Q62165 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Dag1Q62165 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dag1Q62165 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dag1Q62165 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms