RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp17a1P27786 507 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccnd3P30282 292 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GlaP51569 419 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TstP52196 297 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dusp2Q05922 318 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4930480E11RikQ0VG34 394 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdk6Q64261 326 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 OmpQ64288 163 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Galk2Q68FH4 458 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Poldip3Q8BG81 420 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mal2Q8BI08 175 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smoc1Q8BLY1 463 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PigzQ8BTP0 560 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r200Q8R281 312 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kctd5Q8VC57 234 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gtf2h3Q8VD76 309 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rab14Q91V41 215 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wdr61Q9ERF3 305 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AireQ9Z0E3 552 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wdr81Q5ND34 1934 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv6-6A0A075B5T3 119 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm14459A2BI73 179 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6576F6YTZ4 274 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdh1F7BJK1 1077 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r12G5E8G1 307 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rem1O35929 297 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lman2lP59481 347 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smpdl3aP70158 445 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 A1bgQ19LI2 512 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cd163Q2VLH6 1121 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Entpd6Q3U0P5 455 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ephx3Q3V1F8 367 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tnfaip3Q60769 775 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pou4f2Q63934 411 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AktipQ64362 292 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zc4h2Q68FG0 224 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Camk2dQ6PHZ2 499 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1284Q8VF29 311 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr170Q8VGL6 313 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Alg14Q9D081 217 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hipk2Q9QZR5 1196 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sac3d1A6H687 427 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm13212B1ASQ7 799 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trabd2bB1ATG9 517 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3542K7N6U2 270 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8926L7MUE8 181 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MaxP28574 160 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ErgP81270 486 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 1700057G04RikQ3V0U0 232 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnajc11Q5U458 559 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim46Q7TNM2 759 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mab21l2Q8BPP1 359 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r83Q8R287 306 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr532Q8VGT4 309 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SostQ99P68 211 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hspa12bQ9CZJ2 685 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lingo1Q9D1T0 614 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ca7Q9ERQ8 264 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fgf20Q9ESL9 211 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcne4Q9WTW3 170 aa9.45□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp952B0V2W4 504 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc22a28B2RT89 552 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm20715E9Q3L7 95 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tsga10ipF7A1F0 157 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r12L7N217 831 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 LifP09056 203 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp28P10078 825 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TaglnP37804 201 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 BckdhaP50136 442 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ChatQ03059 641 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HbegfQ06186 208 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc6a4Q60857 630 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 OgnQ62000 298 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Abcg1Q64343 666 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Phf21aQ6ZPK0 659 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ube2r2Q6ZWZ2 238 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tctn1Q8BZ64 593 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdhga12Q91XY7 932 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CtsqQ91ZF4 343 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc22a30Q96LX3 552 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hspa14Q99M31 509 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ska2Q9CR46 120 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zbtb8aQ9CWH1 434 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SmpxQ9DC77 85 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sertad3Q9ERC3 197 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aldh9a1Q9JLJ2 494 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ulk2Q9QY01 1037 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gstz1Q9WVL0 216 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sppl2cA2A6C4 690 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmsb15aA2AEH9 79 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 H2-M11F6U8V3 335 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wsb2O54929 404 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prkag1O54950 330 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nid1P10493 1245 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 JundP15066 341 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Yap1P46938 488 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P58686 83 aa9.44□□□□□ -0.9
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hoxd13P70217 339 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.8 ms