RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	PINLYP	A6NC86	204 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197		H3BQF6	201 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	HRK	O00198	91 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	AQP7	O14520	342 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNHIT1	O43257	154 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	WDR1	O75083	606 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNX4	O95219	450 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGHG3	P01860	377 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYL2	P10916	166 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	GABRA1	P14867	456 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	GDF1	P27539	372 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SSTR4	P31391	388 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRT20	P35900	424 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRKAA2	P54646	552 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	PMPCA	Q10713	525 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	LCP2	Q13094	533 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TOMM20	Q15388	145 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	NTRK2	Q16620	822 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	IMPG1	Q17R60	797 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPIN4	Q56A73	249 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIL	Q7L0X0	811 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SENP1	Q9P0U3	644 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRODH2	Q9UF12	536 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	MID2	Q9UJV3	735 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	NOTCH2	Q04721	2471 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCDH7	O60245	1069 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	DLX3	O60479	287 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRAPPC6A	O75865	159 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	DRD2	P14416	443 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	DCAF7	P61962	342 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	FUT7	Q11130	342 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC153	Q494R4	210 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	UNC50	Q53HI1	259 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRRC46	Q96FV0	321 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM237	Q96Q45	408 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	HBEGF	Q99075	208 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	MCM8	Q9UJA3	840 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB4-222	ENST00000614197	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A1B0GVC2	190 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMIM23	A6NLE4	172 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPP6C	O00743	305 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADAM10	O14672	748 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACOX3	O15254	700 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP1B1	P05026	303 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	NAGA	P17050	411 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	GSTM5	P46439	218 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	FBXW4	P57775	412 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	PSPH	P78330	225 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	BTK	Q06187	659 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	FOXO1	Q12778	655 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAP4K2	Q12851	820 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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