RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MMP17Q9ULZ9 603 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CDH10Q9Y6N8 788 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 POM121CA8CG34 1229 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 F8W036 122 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 QSOX1O00391 747 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 DLL1O00548 723 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TOXO94900 526 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CBX7O95931 251 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 FDXRP22570 491 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PIK3CGP48736 1102 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CST6Q15828 149 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MLIPQ5VWP3 458 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CALHM3Q86XJ0 350 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CRELD1Q96HD1 420 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 GABARAPL3Q9BY60 117 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 REEP1Q9H902 201 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 NCDNQ9UBB6 729 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MAPRE3Q9UPY8 281 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PP55 124 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PRRT4C9JH25 899 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SLC31A1O15431 190 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CDKN2CP42773 168 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 WNT3AP56704 352 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF33AQ06730 810 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ABRAXAS2Q15018 415 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TEAD4Q15561 434 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 UGT8Q16880 541 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 RANBP10Q6VN20 620 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 FAM92BQ6ZTR7 304 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CRLS1Q9UJA2 301 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 BAIAP2Q9UQB8 552 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ATG2BQ96BY7 2078 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 KNL1Q8NG31 2342 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 LEFTY1O75610 366 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 RGS11O94810 467 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 EPOP01588 193 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HLA-DQB2P05538 268 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PRKAR1AP10644 381 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 C5AR1P21730 350 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MAOBP27338 520 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HOXC13P31276 330 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 LTB4RQ15722 352 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM196Q5HYL7 178 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 LIPKQ5VXJ0 399 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 C22orf42Q6IC83 251 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PAQR3Q6TCH7 311 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PDZD3Q86UT5 571 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TSGA13Q96PP4 275 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MED28Q9H204 178 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ACSL5Q9ULC5 683 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 IFNA14P01570 189 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 ESR1P03372 595 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SLC2A4P14672 509 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 POU2F1P14859 743 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 MZT2BQ6NZ67 158 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PAQR6Q6TCH4 344 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 VPS37AQ8NEZ2 397 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 OR52J3Q8NH60 311 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 OR52E6Q96RD3 313 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 IER2Q9BTL4 223 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 LIPT1Q9Y234 373 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PADI2Q9Y2J8 665 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 FAM74A7A6NL05 159 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 FAM220BPB1ANY3 271 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SLC30A4O14863 429 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HPGDSO60760 199 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 SCG5P05408 212 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 HLA-DPA1P20036 260 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-211ENST00000520276 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms