RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504292.1

ABCE1-204, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 3

Gene ABCE1, Length 625 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-204	ENST00000504292	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SCML4	Q8N228	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ART4	Q93070	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	RAB7B	Q96AH8	199 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	DDA1	Q9BW61	102 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CENPE	Q02224	2701 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292		A6NCN8	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	PLOD2	O00469	737 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GPR137B	O60478	399 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CLDN11	O75508	207 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	TM7SF2	O76062	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ADCY5	O95622	1261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	RHOC	P08134	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	VDR	P11473	427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GJB2	P29033	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	EPHA2	P29317	976 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CCR1	P32246	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	UGT1A3	P35503	534 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ACADSB	P45954	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	NUMB	P49757	651 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GPR143	P51810	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	PDX1	P52945	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SNX16	P57768	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	DAOA	P59103	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	KRT39	Q6A163	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	UBA3	Q8TBC4	463 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	STARD8	Q92502	1023 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	BMF	Q96LC9	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	MIS12	Q9H081	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292		J3QR06	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292		M0QYV0	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	PDXK	O00764	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-204	ENST00000504292	OGG1	O15527	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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