RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TspearJ3S6Y1 670 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FiglaO55208 194 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nsg2P47759 171 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdc42P60766 191 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KapP61110 121 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ntsr2P70310 416 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snx6Q6P8X1 406 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd3eapQ76KJ5 399 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem159Q922Z1 161 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ssr2Q9CPW5 183 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NaaaQ9D7V9 362 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dgat2Q9DCV3 388 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r52Q9EP79 309 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tssc4Q9JHE7 317 aa19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Coro1bQ9WUM3 484 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Auts2A0A087WPF7 1261 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mybpc1D3YU50 1127 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3594E9Q2A7 267 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KeraO35367 351 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tgfb3P17125 410 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Impdh2P24547 514 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itgb2lQ3UV74 738 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myl12aQ6ZWQ9 172 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tex13c3Q810P0 219 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm9881Q8BR56 211 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pqlc3Q8C6U2 202 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hbp1Q8R316 516 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mospd1Q8VEL0 213 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1361Q8VFH0 317 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr868Q8VFI8 309 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr525Q8VGL5 309 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mat1aQ91X83 396 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgre4Q91ZE5 689 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tram2Q924Z5 370 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf144aQ925F3 292 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr44Q9EQB8 314 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rhox2dW4VSN9 191 aa19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slfn3A0A1L1STQ7 640 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp969A2ART2 485 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp973A2BE20 318 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Xlr5aA2BI45 236 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adam34A2RSG8 714 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Catsperg1E9Q355 1151 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgap40E9Q6X9 672 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il20rbE9Q9A6 308 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nudt19P11930 357 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Man2a1P27046 1150 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DbtP53395 482 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tra2bP62996 288 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptpn2Q06180 406 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Taar2Q5QD17 339 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zscan26Q5RJ54 466 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q6P1I3 445 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc39a10Q6P5F6 833 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Osgepl1Q6PEB4 414 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cstf2Q8BIQ5 580 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8C0X8 640 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mospd2Q9CWP6 518 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ift27Q9D0P8 186 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spesp1Q9D5A0 399 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tlr4Q9QUK6 835 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1375A0A0N4SUP0 313 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 A0A286YDU1 74 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mamdc4A2AJA7 1228 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr74A2BHP6 318 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5724L7N264 670 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RaxO35602 342 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CtnsP57757 367 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AbatP61922 500 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scn1bP97952 218 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rars2Q3U186 578 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fjx1Q8BQB4 450 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam69cQ8BQT2 410 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxl22Q8C7B6 236 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Crlf2Q8CII9 359 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lactb2Q99KR3 288 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Txndc9Q9CQ79 226 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zcchc12Q9CZA5 402 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sec23bQ9D662 767 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hspb11Q9D6H2 143 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Jph1Q9ET80 660 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PolmQ9JIW4 496 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Syt11Q9R0N3 430 aa19.95■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr663A0A1B0GSI9 319 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21800J3QMJ9 180 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tuba1bP05213 451 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gabra3P26049 492 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppm1bP36993 390 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atxn1P54254 791 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CtskP55097 329 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tuba1aP68369 451 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EvlP70429 414 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sox9Q04887 507 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PomkQ3TUA9 349 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C2cd4cC2CD4Q5HZI2 419 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Runx1t1Q61909 577 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bend6Q6PFX2 281 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf592Q8BHZ4 1262 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ugt2a3Q8BWQ1 534 aa19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lcmt2Q8BYR1 686 aa19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.2 ms