RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039559.8

Thbs1-201, Transcript of Thrombospondin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Thbs1, Length 5,848 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Supv3l1Q80YD1 779 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rab39aQ8BHD0 217 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Frs2Q8C180 508 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mcoln1Q99J21 580 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Thumpd1Q99J36 350 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dph2Q9CR25 489 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cmtm2aQ9DAR1 169 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 B4galt2Q9Z2Y2 369 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Map2P20357 1828 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr640E9Q7P5 314 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm4847G3X946 537 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dok2O70469 412 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kcnc1P15388 511 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cfl1P18760 166 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 SmoP56726 793 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Bpifa1P97361 278 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Psg28Q4KL66 472 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 SnupnQ80W37 358 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fndc9Q8BJN4 226 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 StgQ8BM15 349 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 AntxrlQ8BVM2 641 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nop16Q9CPT5 178 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 VasnQ9CZT5 673 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ints12Q9D168 461 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc34a2Q9DBP0 697 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ccdc107Q9DCC3 242 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Clca3a2Q9EQR4 902 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nectin1Q9JKF6 515 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Clca3a1Q9QX15 902 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hbb-bh2B2RVB7 147 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyp4a31F8WGU9 509 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Entpd2O55026 495 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fosl2P47930 326 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rln1P47932 185 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ctbp2P56546 445 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 S100a1P56565 94 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Acot8P58137 320 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 MagixQ4KL35 324 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cln3Q61124 438 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mal2Q8BI08 175 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Adhfe1Q8R0N6 465 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem5Q8VDX6 444 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr1208Q8VG47 308 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr539Q8VGL9 319 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mdm1Q9D067 708 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mterf1bB9EJ57 379 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm5519D3Z175 170 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sypl1O09117 261 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyp2j5O54749 501 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cd14P10810 366 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gstm3P19639 218 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 StomP54116 284 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Arf3P61205 181 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Arf1P84078 181 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Commd6Q3V4B5 87 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Adh7Q64437 374 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr538Q7TRT5 310 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PgghgQ8BP56 690 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Npsr1Q8BZP8 371 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Q8CF31 99 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lipt1Q8VCM4 373 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 AdprmQ99KS6 340 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc39a5Q9D856 535 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tsga8Q9JJL0 238 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fbxo17Q9QZM8 286 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn2r56E9Q4U5 779 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr605E9Q838 314 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pdlim3O70209 316 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hoxd13P70217 339 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pde7aP70453 456 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sh3bp2Q06649 559 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Siah1bQ06985 282 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr1136Q0VBI4 310 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Xrra1Q3U3V8 786 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 FukQ7TMC8 1090 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PxkQ8BX57 582 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fbxl3Q8C4V4 428 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn1r22Q8R2D1 302 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tspan33Q8R3S2 283 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zfyve21Q8VCM3 234 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rad51cQ924H5 366 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tcam1Q99NB3 548 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Q9D112 206 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr955Q9EQ97 314 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pdzk1Q9JIL4 519 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PrelpQ9JK53 378 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 RbmxQ9WV02 391 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mtm1Q9Z2C5 603 aa8.93□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm21936A0A1Y7VJE9 144 aa8.92□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn2r110E9PWD5 858 aa8.92□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn2r88L7N1W8 857 aa8.92□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cldn4O35054 210 aa8.92□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ccrl2O35457 360 aa8.92□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 GlaP51569 419 aa8.92□□□□□ -0.98
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdh11P55288 796 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.4 ms