RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494674.1

PRPF4B-209, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,727 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-209ENST00000494674 FAM60AQ9NP50 221 aa10□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 PRDM9Q9NQV7 894 aa10□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 ACER3Q9NUN7 267 aa10□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 NTMQ9P121 344 aa10□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 P2RX2Q9UBL9 471 aa10□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 SH3GLB1Q9Y371 365 aa10□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 SLC22A7Q9Y694 548 aa10□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 ZNF860A6NHJ4 632 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 TLR4O00206 839 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 TNFRSF11BO00300 401 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 BCKDKO14874 412 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 EMC8O43402 210 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 B3GALT2O43825 422 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 SLC28A2O43868 658 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 FESP07332 822 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 CHRM4P08173 479 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 HTR1AP08908 422 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 CYP4B1P13584 511 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 MATN1P21941 496 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 CRHBPP24387 322 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 RYKP34925 604 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 KCNJ5P48544 419 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 RGS19P49795 217 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 ARHGDIAP52565 204 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 HMGA2P52926 109 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 CDH12P55289 794 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 OLR1P78380 273 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 KCNC4Q03721 635 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 KEAP1Q14145 624 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 MEP1AQ16819 746 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 ABHD13Q7L211 337 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 SZRD1Q7Z422 152 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 LGI4Q8N135 537 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 ARL14Q8N4G2 192 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 SGCDQ92629 289 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 SHDQ96IW2 340 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 MAGED4Q96JG8 741 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 NELL2Q99435 816 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 PITX2Q99697 317 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 PIP5K1AQ99755 562 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 PSD2Q9BQI7 771 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 RIBC2Q9H4K1 309 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 TBC1D17Q9HA65 648 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 IL21RQ9HBE5 538 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 LYRM4Q9HD34 91 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 EXD2Q9NVH0 621 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 RLIMQ9NVW2 624 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 URADA6NGE7 173 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 K7ESF4 209 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 PDE9AO76083 593 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 EPPINO95925 133 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 FOSL2P15408 326 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 ITGA2P17301 1181 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 RHCEP18577 417 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 AGXTP21549 392 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 BCKDHBP21953 392 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 CPN2P22792 545 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 MPIP34949 423 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 NXPH1P58417 271 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 SPIBQ01892 262 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 ELOCQ15369 112 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 MANEAQ5SRI9 462 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 ZNF773Q6PK81 442 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 FAM111BQ6SJ93 734 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 SLC5A8Q8N695 610 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 CSNK1A1LQ8N752 337 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 ATG16L2Q8NAA4 619 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 OR7G2Q8NG99 324 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 GIPC3Q8TF64 312 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 XAGE5Q8WWM1 108 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 KAT2AQ92830 837 aa9.99□□□□□ -0.81
PRPF4B-209ENST00000494674 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms