RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa3.76□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa3.76□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM265A0A087WTH1 108 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0G2JNG1 304 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM247A6NEH6 219 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ENO4A6NNW6 628 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf74A8MZ97 194 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 C10orf142B7Z368 130 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 H0YGG7 62 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TGFBR3LH3BV60 316 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KIR2DS3K7RE56 304 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 BCKDKO14874 412 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJB6O75190 326 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TFPTP0C1Z6 253 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NR2F1P10589 423 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CPN2P22792 545 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 EPHA2P29317 976 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GSTT1P30711 240 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MPIP34949 423 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1CAP62136 330 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TUBA4AP68366 448 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 OLR1P78380 273 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 IL5RAQ01344 420 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CD47Q08722 323 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FZD5Q13467 585 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KIR2DS5Q14953 304 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC48A1Q6P1K1 146 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM107Q6UX40 140 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC80Q76M96 950 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PARGQ86W56 976 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ARMC8Q8IUR7 673 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4N5Q8IXE1 308 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CAMKVQ8NCB2 501 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KAT2AQ92830 837 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TBC1D20Q96BZ9 403 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 COL21A1Q96P44 957 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SPOCK3Q9BQ16 436 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SERHL2Q9H4I8 314 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 EQTNQ9NQ60 294 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SEMA3GQ9NS98 782 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT84Q9NSB2 600 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GIMAP4Q9NUV9 329 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RHCGQ9UBD6 479 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 AASSQ9UDR5 926 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PSME2Q9UL46 239 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 COL4A2P08572 1712 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 URADA6NGE7 173 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PTGES3LE9PB15 166 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 VILLO15195 856 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAMDEC1O15204 470 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TNFSF14O43557 240 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHA1P01876 353 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 WNT1P04628 370 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NR2F6P10588 404 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ITGA2P17301 1181 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 AGXTP21549 392 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FUT4P22083 530 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SOX18P35713 384 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TSFMP43897 325 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RXRGP48443 463 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GSSP48637 474 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MAZP56270 477 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ISL1P61371 349 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ESRRGP62508 458 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RAPSNQ13702 412 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RUNX2Q13950 521 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MLC1Q15049 377 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 C6orf141Q5SZD1 244 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ARMC6Q6NXE6 501 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 Q7L0L9 218 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HMGN2P46Q86SG4 172 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC30A8Q8IWU4 369 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 DOK4Q8TEW6 326 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GIPC3Q8TF64 312 aa3.75□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFPM2Q8WW38 1151 aa3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms