RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERVK-8P63133 956 aa14.22□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OGFOD2Q6N063 350 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.22□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYOTQ9UBF9 498 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFL2Q9Y281 166 aa14.22□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.22□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.21□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUV39H1O43463 412 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRB1P04280 392 aa14.21□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.21□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.21□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPCDCQ96CD2 204 aa14.21□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 BBS4Q96RK4 519 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPAS2Q99743 824 aa14.21□□□□□ -0.13
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PS29 197 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TGDSO95455 350 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD97P48960 835 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYB561P49447 251 aa14.2□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.2□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.2□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SDHDO14521 159 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLOD3O60568 738 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRAMEF2O60811 474 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITGA10O75578 1167 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 S1PR1P21453 382 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLCSP50747 726 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSR4P51571 173 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MGAT2Q10469 447 aa14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.19□□□□□ -0.14
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