RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000198767.10

RRN3-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 3,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-201ENST00000198767 C7orf34Q96L11 122 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 LGR4Q9BXB1 951 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 ZNF556Q9HAH1 456 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 TRPC4Q9UBN4 977 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 V9GYH0 126 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 COL4A6Q14031 1691 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 TTC28Q96AY4 2481 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 PRAMEF10O60809 474 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 KLK1P06870 262 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 SSTR2P30874 369 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 C2orf80Q0P641 193 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 C17orf64Q86WR6 236 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 OR4M1Q8NGD0 313 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 OR4A15Q8NGL6 344 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 OPALINQ96PE5 141 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 HHATLQ9HCP6 504 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 B4DXG7 233 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 DNAJB5O75953 348 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 CCNB2O95067 398 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 CSF3P09919 207 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 MAPK1P28482 360 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 EVI2BP34910 448 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 MMP12P39900 470 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 CD79BP40259 229 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 ACTR1BP42025 376 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 MAGEA2P43356 314 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 OR3A3P47888 321 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 ACTR1AP61163 376 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 C1orf61Q13536 156 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 DUOXA1Q1HG43 343 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 CBLL1Q75N03 491 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 RAB42Q8N4Z0 105 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 ASB11Q8WXH4 323 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 NEIL2Q969S2 332 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 RACGAP1Q9H0H5 632 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 MKLN1Q9UL63 735 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 GABRR3A8MPY1 467 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 TOXO94900 526 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 C6orf47O95873 294 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 YES1P07947 543 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 EBLN1P0CF75 366 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 ZNF250P15622 560 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 ITGA1P56199 1179 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 CXCR4P61073 352 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 HYAL2Q12891 473 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 POU4F3Q15319 338 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 DEF8Q6ZN54 512 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 GALNT7Q86SF2 657 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 DTD2Q96FN9 168 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 ALG5Q9Y673 324 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 H0Y8X5 98 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 OR2B3O76000 313 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 CH25HO95992 272 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-201ENST00000198767 CHMP24386 653 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms