RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J CEX1Q12453 761 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J ZPS1Q12512 249 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J KEX2P13134 814 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J ADE2P21264 571 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PRR1P28708 518 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J NAM7P30771 971 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SYN8P31377 255 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J HEL1P36113 551 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL7P36519 292 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PGM2P37012 569 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J CCL1P37366 393 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J VID24P38263 362 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SIP3P38717 1229 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YFL052WP43551 465 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J TOF1P53840 1238 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J CBK1P53894 756 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL146WP53906 100 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J NAF1P53919 492 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J ARK1P53974 638 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SPP1Q03012 353 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR407WQ06070 228 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MRI1Q06489 411 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SHS1Q07657 551 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PSR2Q07949 397 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J IES4Q08561 116 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR296WQ08748 1289 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J DCS2Q12123 353 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J GET3Q12154 354 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J REC8Q12188 680 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD59Q12223 238 aa2.92□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J TIF1P10081 395 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL4AP10664 362 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J POL3P15436 1097 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RGP1P16664 663 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PFK1P16861 987 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RPC31P17890 251 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J GLN3P18494 730 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J BET2P20133 325 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J CBP3P21560 335 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RAM1P22007 431 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MBR1P23493 339 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.91□□□□□ -1.94not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP22P24384 1145 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J COT1P32798 439 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL097CP34245 136 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PPS1P38148 807 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YHL017WP38745 532 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR202WP38887 602 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MMF1P40185 145 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YTA12P40341 825 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J HUL4P40985 892 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL4BP49626 362 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J UBA2P52488 636 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J GUP1P53154 560 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MNP1P53163 194 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J BIO5P53744 561 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J UBP10P53874 792 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J CWC21Q03375 135 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP14Q04500 899 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J YML083CQ04526 418 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PIG1Q06216 648 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J SGO1Q08490 590 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data2.91□□□□□ -1.94not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J TIP41Q12199 356 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J MNL2Q12205 849 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J PTC5Q12511 572 aa2.91□□□□□ -1.94
tW(CCA)JtW(CCA)J CPA2P03965 1118 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J COX4P04037 155 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SPE1P08432 466 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RNR2P09938 399 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL076C-AP0CX16 216 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR464WP0CX17 216 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MAS1P10507 462 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TCP1P12612 559 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J DAL7P21826 554 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PDE1P22434 369 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J IMG2P25642 146 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD27P26793 382 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SKG6P32900 734 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD2P33314 1104 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MRX3P38172 270 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J UBP13P38187 747 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J STB5P38699 743 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX28P38848 579 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL076CP39971 216 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YER186CP40101 306 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MOB1P40484 314 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ORC5P50874 479 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J NUT1P53114 1132 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CUL3P53202 744 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TAM41P53230 385 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ART5P53244 586 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ENV11P53246 860 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RTC4P53850 401 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ALG11P53954 548 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J VTC3Q02725 835 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J EEB1Q02891 456 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
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