RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	YLL058W	Q12198	575 aa		2.74	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	BI4	P03879	638 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	GCR1	P07261	785 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	ATE1	P16639	503 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	YUR1	P26725	428 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	RAD27	P26793	382 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	UGA2	P38067	497 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	MET10	P39692	1035 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	YML020W	Q03722	664 aa		2.73	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	ALG7	P07286	448 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	SPE1	P08432	466 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	DUT1	P33317	147 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	RER2	P35196	286 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	PNT1	P38969	423 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	SUT2	Q12286	268 aa		2.72	□□□□□ -1.97
YJL135W	YJL135W	CDC34	P14682	295 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	LYP1	P32487	611 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	ATG19	P35193	415 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	YGR012W	P53206	393 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	SVF1	Q05515	481 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	MRL1	Q06815	381 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	ACM1	Q08981	209 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	RKM4	Q12504	494 aa		2.71	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	MLS1	P30952	554 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	SCT1	P32784	759 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	SLA2	P33338	968 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	CCC2	P38995	1004 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	FYV10	P40492	516 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	MCM2	P29469	868 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	RPC82	P32349	654 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	TDP1	P38319	544 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	YHL017W	P38745	532 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	DAS1	P47005	663 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	YGR053C	P53234	283 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	CDA1	Q06702	301 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	RGT1	P32862	1170 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.68	□□□□□ -1.98	not detected
YJL135W	YJL135W	FLO10	P36170	1169 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	YAP1801	P38856	637 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	MTC3	P53077	123 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	EEB1	Q02891	456 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	SPR28	Q04921	423 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	THI7	Q05998	598 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	XYL2	Q07993	356 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	MXR1	P40029	184 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	TAH11	P47112	604 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	TYW3	P53177	273 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	OSW2	Q12202	724 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	HSF1	P10961	833 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	PET112	P33893	541 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
YJL135W	YJL135W	SPO20	Q04359	397 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	ARO10	Q06408	635 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YJL135W	YJL135W	CLN2	P20438	545 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	AGP1	P25376	633 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	FUN30	P31380	1131 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	SHE9	Q04172	456 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	INO1	P11986	533 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	YKL107W	P34251	309 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	YKL151C	P36059	337 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	MCM7	P38132	845 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	YIL166C	P40445	542 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	STB2	P46679	850 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	SRT1	Q03175	343 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	MDM38	Q08179	573 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	PIN2	Q12057	282 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	YPL066W	Q12194	479 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	TRM13	Q12383	476 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	CDC43	P18898	376 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	SRP101	P32916	621 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	GAT1	P43574	510 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	PPS1	P38148	807 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	SIT1	P39980	628 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.62	□□□□□ -1.99	not detected
YJL135W	YJL135W	YGL176C	P46945	554 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YJL135W	YJL135W	GYP7	P48365	746 aa		2.62	□□□□□ -1.99

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