RNA–Protein interactions for RNA: YGR229C

SMI1, Transcript of Protein involved in the regulation of cell wall synthesis, yeast

Gene SMI1, Length 1,518 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMI1	YGR229C	RGD2	P43556	714 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	BSC2	Q05611	235 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	MSS18	P08593	268 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	YKL133C	P36066	463 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	CAB3	P36076	571 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	ESL2	P36168	1195 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	BCD1	P38772	366 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	DSS1	P39112	969 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	MGS1	P40151	587 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	YIL165C	P40446	119 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	PRK1	P40494	810 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	ALR2	P43553	858 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	MET13	P53128	600 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	NSE5	Q03718	556 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	SHE9	Q04172	456 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	GIC2	Q06648	383 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	MDM12	Q92328	271 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	TOP3	P13099	656 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	SAN1	P22470	610 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	UBS1	P38290	277 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	RRF1	P38771	230 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	POP2	P39008	433 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	IML2	P47031	731 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	YAP1802	P53309	568 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	YNR014W	P53719	212 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	ULP1	Q02724	621 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	ADI1	Q03677	179 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	CIA1	Q05583	330 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	SGD1	Q06132	899 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	SPT7	P35177	1332 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	VBA3	P25594	458 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	PXA2	P34230	853 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	MRP8	P35719	219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	PSY2	P40164	858 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	NIT2	P47016	307 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	GNP1	P48813	663 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	GTR1	Q00582	310 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	CMP2	P14747	604 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	ACE2	P21192	770 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	PBY1	P38254	753 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	RET2	P43621	546 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	SAE2	P46946	345 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	YJR096W	P47137	282 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	YNR063W	P53749	607 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
SMI1	YGR229C	ARA2	Q04212	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	TDA6	Q06466	467 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	MRL1	Q06815	381 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	RSC58	Q07979	502 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	LAP2	Q10740	671 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SMI1	YGR229C	INO80	P53115	1489 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	FLP1	P03870	423 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SPC29	P33419	253 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	YKL100C	P34248	587 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	CCC2	P38995	1004 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	XKS1	P42826	600 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	QRI7	P43122	407 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	CNN1	P43618	361 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PPT1	P53043	513 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PCL10	P53124	433 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	OPY2	Q06810	360 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	AEP2	P22136	580 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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