RNA–Protein interactions for RNA: Q0065

AI4, Transcript of Endonuclease I-SceII, yeast

Gene AI4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI4	Q0065	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	HUL5	P53119	910 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	ERP6	P53198	216 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	DOS2	P54858	310 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	MSC2	Q03455	724 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	MLS1	P30952	554 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	YBR184W	P38299	523 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	YGL176C	P46945	554 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	TPO2	P53283	614 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	BUD6	P41697	788 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	GCV2	P49095	1034 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	FMP25	Q08023	583 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	FLC1	Q08967	793 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	GAL11	P19659	1081 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	CDC11	P32458	415 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	STE5	P32917	917 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	PLB1	P39105	664 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	YGR125W	P53273	1036 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	RNH70	P53331	553 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	EAF1	Q06337	982 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	CIT1	P00890	479 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	PPG1	P32838	368 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
AI4	Q0065	GEM1	P39722	662 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	MND2	P40577	368 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	HUL4	P40985	892 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	PPM2	Q08282	695 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	CIT2	P08679	460 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	ACE2	P21192	770 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	OAR1	P35731	278 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	BRN1	P38170	754 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	ESC2	Q06340	456 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	YPL066W	Q12194	479 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AI4	Q0065	ARE1	P25628	610 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	PNT1	P38969	423 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	ADY3	Q07732	790 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	TPO1	Q07824	586 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	YLR125W	Q12138	136 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	PFD1	P46988	109 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	MOH1	P38191	138 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	MBP1	P39678	833 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	RRT14	P40470	206 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	MET12	P46151	657 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	EXG2	P52911	562 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	ACM1	Q08981	209 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	NUP82	P40368	713 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	ALR2	P43553	858 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
AI4	Q0065	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	ADE8	P04161	214 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	CAN1	P04817	590 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	HIS5	P07172	385 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	PHO8	P11491	566 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	SIT1	P39980	628 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	ALG12	P53730	551 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	YLL058W	Q12198	575 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	BI4	P03879	638 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	UGA2	P38067	497 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	POA1	P38218	177 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	TAF8	Q03750	510 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	AIM39	Q08223	395 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	SPC42	P36094	363 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	CHA4	P43634	648 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	HFM1	P51979	1187 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	YDR306C	Q06640	478 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	PPH3	P32345	308 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	SLA2	P33338	968 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	CCC2	P38995	1004 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	ZRG8	P40021	1076 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	MXR1	P40029	184 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	UBA2	P52488	636 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.66	not detected
AI4	Q0065	UBX5	Q06682	500 aa		4.65	□□□□□ -1.66
AI4	Q0065	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	THI4	P32318	326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	TIM23	P32897	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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