RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 AK9Q5TCS8 1911 aa22.56■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 NUCB2P80303 420 aa22.55■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.55■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.55■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 IL17RAQ96F46 866 aa22.55■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 ERBB4Q15303 1308 aa22.55■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 MYL6BP14649 208 aa22.54■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 TRAK2O60296 914 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 COPS6Q7L5N1 327 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 SUCLG2Q96I99 432 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.53■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 IGKV5-2P06315 115 aa22.52■■□□□ 1.2
CLN8-211ENST00000636934 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 GCKRQ14397 625 aa22.51■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.51■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 MYD88Q99836 296 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 USP16Q9Y5T5 823 aa22.5■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 COL15A1P39059 1388 aa22.49■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 NEK4P51957 841 aa22.49■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 SGSM2O43147 1006 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 KAZALD1Q96I82 304 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 ABCA3Q99758 1704 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 IL2RBP14784 551 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.48■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 HSPA4P34932 840 aa22.46■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 AACSQ86V21 672 aa22.46■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.46■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 RAD50Q92878 1312 aa22.46■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 HIP1O00291 1037 aa22.45■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 EVI5LQ96CN4 794 aa22.45■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.45■■□□□ 1.19
CLN8-211ENST00000636934 SSFA2P28290 1259 aa22.45■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 GLI3P10071 1580 aa22.45■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.44■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.44■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 EVA1CP58658 441 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 PALD1Q9ULE6 856 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 SASH1O94885 1247 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 COPRSQ9NQ92 184 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 PAPPAQ13219 1627 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 TMX3Q96JJ7 454 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 CUL4AQ13619 759 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CLN8-211ENST00000636934 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 A0A087WZG4 1122 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 FSD2A1L4K1 749 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 SIL1Q9H173 461 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 IL25Q9H293 177 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 STRN4Q9NRL3 753 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 TNS2Q63HR2 1409 aa22.37■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.37■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.37■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.37■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.36■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 NBPF26B4DH59 902 aa22.35■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 NBPF14Q5TI25 921 aa22.35■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 NBPF15Q8N660 670 aa22.35■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.34■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 CASP7P55210 303 aa22.34■■□□□ 1.17
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