RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630951.1

RAB28-208, Transcript of RAB28, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB28, Length 1,679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB28-208	ENST00000630951	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951		H0YIN7	160 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	PDE6B	P35913	854 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	HLF	Q16534	295 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	27.87	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	NPHP1	O15259	732 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	PDIA6	Q15084	440 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	ZNF853	P0CG23	659 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	ST5	P78524	1137 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	IFT57	Q9NWB7	429 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	HOXB7	P09629	217 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	KRT24	Q2M2I5	525 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	TTLL6	Q8N841	843 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	MBIP	Q9NS73	344 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RAB28-208	ENST00000630951	GNAI1	P63096	354 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	ADCY9	O60503	1353 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	ATP10D	Q9P241	1426 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	CCDC27	Q2M243	656 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	PROSER3	Q2NL68	480 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	27.8	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	NECTIN2	Q92692	538 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	NUP98	P52948	1817 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	ANXA1	P04083	346 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	27.77	■■■□□ 2.04	2e-6	■□□□□ 10.3
RAB28-208	ENST00000630951	NYX	Q9GZU5	481 aa		27.77	■■■□□ 2.04
RAB28-208	ENST00000630951	SRGN	P10124	158 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	COPS6	Q7L5N1	327 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	FAM177B	A6PVY3	158 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	STYK1	Q6J9G0	422 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	WWC1	Q8IX03	1113 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	CNKSR1	Q969H4	720 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	MASTL	Q96GX5	879 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	GPT	P24298	496 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	PARP10	Q53GL7	1025 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RAB28-208	ENST00000630951	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	NPR1	P16066	1061 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	SUSD4	Q5VX71	490 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	HYPK	Q9NX55	129 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	IL16	Q14005	1332 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		27.67	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	ERFE	Q4G0M1	354 aa		27.67	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		27.67	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	C21orf2	O43822	256 aa		27.66	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	NTSR2	O95665	410 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	TCIRG1	Q13488	830 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	RNF181	Q9P0P0	153 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	ABCC12	Q96J65	1359 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	CRY2	Q49AN0	593 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	LMNB1	P20700	586 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	SOGA3	Q5TF21	947 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
RAB28-208	ENST00000630951	ALDH1B1	P30837	517 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RAB28-208	ENST00000630951	RASSF7	Q02833	373 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RAB28-208	ENST00000630951	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
RAB28-208	ENST00000630951	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RAB28-208	ENST00000630951	SBF1	O95248	1867 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RAB28-208	ENST00000630951	NFKBIE	O00221	500 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RAB28-208	ENST00000630951	WDR63	Q8IWG1	891 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RAB28-208	ENST00000630951	SLX4	Q8IY92	1834 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RAB28-208	ENST00000630951	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms