RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620944.4

NME4-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-211ENST00000620944 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
NME4-211ENST00000620944 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
NME4-211ENST00000620944 TTLL6Q8N841 843 aa28.4■■■□□ 2.14
NME4-211ENST00000620944 ERBB4Q15303 1308 aa28.4■■■□□ 2.14
NME4-211ENST00000620944 ANP32CO43423 234 aa28.39■■■□□ 2.14
NME4-211ENST00000620944 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
NME4-211ENST00000620944 BCORQ6W2J9 1755 aa28.39■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 ADCY9O60503 1353 aa28.38■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.134e-12■□□□□ 10
NME4-211ENST00000620944 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 APAF1O14727 1248 aa28.37■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 CHL1O00533 1208 aa28.36■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 HLFQ16534 295 aa28.36■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.36■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 FAM177BA6PVY3 158 aa28.35■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.35■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.35■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.34■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.34■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 NECTIN2Q92692 538 aa28.33■■■□□ 2.13
NME4-211ENST00000620944 C9orf131Q5VYM1 1079 aa28.32■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 CFAP44Q96MT7 982 aa28.32■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa28.31■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 CCDC184Q52MB2 194 aa28.3■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 NYXQ9GZU5 481 aa28.3■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 MRS2Q9HD23 443 aa28.3■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 C1QTNF8P60827 252 aa28.29■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 CNKSR1Q969H4 720 aa28.29■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 RNF181Q9P0P0 153 aa28.29■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 KRT24Q2M2I5 525 aa28.28■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 STYK1Q6J9G0 422 aa28.28■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 MASTLQ96GX5 879 aa28.28■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 ANXA1P04083 346 aa28.27■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 GPTP24298 496 aa28.27■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 PDIA6Q15084 440 aa28.27■■■□□ 2.12
NME4-211ENST00000620944 SRGNP10124 158 aa28.26■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 PROSER3Q2NL68 480 aa28.26■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.26■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 MBIPQ9NS73 344 aa28.26■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 DLEC1Q9Y238 1755 aa28.26■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 HOXB7P09629 217 aa28.25■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 GNAI1P63096 354 aa28.25■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 RASSF7Q02833 373 aa28.25■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 IFT57Q9NWB7 429 aa28.25■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.24■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 C21orf2O43822 256 aa28.24■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.119e-11■■■■■ 80.7
NME4-211ENST00000620944 NPR1P16066 1061 aa28.23■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 LMNB1P20700 586 aa28.22■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.22■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 COPS6Q7L5N1 327 aa28.22■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.22■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.22■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.22■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.22■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.2■■■□□ 2.11
NME4-211ENST00000620944 ZNF853P0CG23 659 aa28.2■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 PARP10Q53GL7 1025 aa28.2■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 SOGA3Q5TF21 947 aa28.2■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.2■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.2■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 ERFEQ4G0M1 354 aa28.19■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.19■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 SUSD4Q5VX71 490 aa28.18■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.17■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 NFKBIEO00221 500 aa28.17■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.17■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 ABCC12Q96J65 1359 aa28.16■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 ALDH1B1P30837 517 aa28.15■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.15■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 HYPKQ9NX55 129 aa28.15■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 NTSR2O95665 410 aa28.14■■■□□ 2.1
NME4-211ENST00000620944 NUP98P52948 1817 aa28.13■■■□□ 2.09
NME4-211ENST00000620944 CCDC27Q2M243 656 aa28.13■■■□□ 2.09
NME4-211ENST00000620944 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.13■■■□□ 2.09
NME4-211ENST00000620944 CCDC93Q567U6 631 aa28.12■■■□□ 2.09
NME4-211ENST00000620944 NMRK2Q9NPI5 230 aa28.12■■■□□ 2.09
NME4-211ENST00000620944 KIF3CO14782 793 aa28.11■■■□□ 2.09
NME4-211ENST00000620944 CRY2Q49AN0 593 aa28.11■■■□□ 2.09
NME4-211ENST00000620944 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.11■■■□□ 2.09
NME4-211ENST00000620944 WWC1Q8IX03 1113 aa28.11■■■□□ 2.09
NME4-211ENST00000620944 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.1■■■□□ 2.09
NME4-211ENST00000620944 PRELPP51888 382 aa28.1■■■□□ 2.09
NME4-211ENST00000620944 TCIRG1Q13488 830 aa28.1■■■□□ 2.09
NME4-211ENST00000620944 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
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