RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-220	ENST00000618056	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PMS1-220	ENST00000618056	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	YY1	P25490	414 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	KCNA3	P22001	575 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	HLF	Q16534	295 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	32.33	■■■□□ 2.77
PMS1-220	ENST00000618056	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	PIM2	Q9P1W9	311 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	32.32	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	CHRNA5	P30532	468 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	CNBD1	Q8NA66	436 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	NECTIN2	Q92692	538 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	IL16	Q14005	1332 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	ANXA1	P04083	346 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	BCS1L	Q9Y276	419 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	ST5	P78524	1137 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PMS1-220	ENST00000618056	PDE6B	P35913	854 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	NPHP1	O15259	732 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	COPS6	Q7L5N1	327 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056		H0YIN7	160 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	NYX	Q9GZU5	481 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PMS1-220	ENST00000618056	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		32.2	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	GPT	P24298	496 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	TSPYL6	Q8N831	410 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	TTLL6	Q8N841	843 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	CACNA1F	O60840	1977 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	FAM177B	A6PVY3	158 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	PARP10	Q53GL7	1025 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	CACNA1S	Q13698	1873 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	SRGN	P10124	158 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	SUSD4	Q5VX71	490 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PMS1-220	ENST00000618056	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		32.14	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	STYK1	Q6J9G0	422 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	32.13	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	SBF1	O95248	1867 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	SLX4	Q8IY92	1834 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	TCIRG1	Q13488	830 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	MASTL	Q96GX5	879 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	NTSR2	O95665	410 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	ABCC12	Q96J65	1359 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	ADCY9	O60503	1353 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	ERFE	Q4G0M1	354 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	CNKSR1	Q969H4	720 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	NLRP10	Q86W26	655 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PMS1-220	ENST00000618056	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73

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